RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474929.1

USP54-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 4

Gene USP54, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-211ENST00000474929 GAGE12JA6NER3 117 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 DIRC3C9JPN6 131 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 MPC2O95563 127 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 IGLC2P0DOY2 106 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 GAGE1Q13065 139 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 GAGE4Q13068 117 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 GAGE5Q13069 117 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 ERCC8Q13216 396 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 TPRXLQ17RH7 258 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 GAGE13Q4V321 117 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 CLLU1Q5K131 121 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 MUC21Q5SSG8 566 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 C10orf113Q5VZT2 155 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 TEX261Q6UWH6 196 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 C9orf62Q8N4C0 152 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 OR5C1Q8NGR4 320 aa4.89□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 LYPD6BQ8NI32 183 aa4.89□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 SMIM3Q9BZL3 60 aa4.89□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.89□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 RAB14P61106 215 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 ZNF266Q14584 549 aa4.88□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.88□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 MLST8Q9BVC4 326 aa4.88□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 ZNF492Q9P255 531 aa4.88□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 H3BQ15 152 aa4.87□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 GZMBP10144 247 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 ZNF876PQ49A33 203 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 C15orf54Q8N8G6 183 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 OR1L4Q8NGR5 311 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 SCGB1C1Q8TD33 95 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 KCNS1Q96KK3 526 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 WFDC1Q9HC57 220 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 HSPB11Q9Y547 144 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.87□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 PET100P0DJ07 73 aa4.86□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 Q5BKY6 102 aa4.86□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.86□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.86□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 MIR17HGQ75NE6 70 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 PHYHIPLQ96FC7 376 aa4.85□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.84□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 C17orf112F2Z3M2 114 aa4.84□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 H0Y9J4 135 aa4.84□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 PRR34Q9NV39 138 aa4.84□□□□□ -1.63
USP54-211ENST00000474929 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.84□□□□□ -1.63
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USP54-211ENST00000474929 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP54-211ENST00000474929 A8MWV9 139 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 P01737 135 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 NBEAP1P0C6P0 100 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 CFAP161Q6P656 301 aa4.83□□□□□ -1.64
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USP54-211ENST00000474929 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 OR2G3Q8NGZ4 309 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 SLC25A2Q9BXI2 301 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.82□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.82□□□□□ -1.64
USP54-211ENST00000474929 SMLR1H3BR10 107 aa4.82□□□□□ -1.64
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