RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515760.1

PEX10-208, Transcript of peroxisomal biogenesis factor 10, human

TSL 4

Gene PEX10, Length 603 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PEX10-208	ENST00000515760	ZFP69	Q49AA0	526 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	PTH2	Q96A98	100 aa		13.83	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760		K7EQM0	130 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	LINC00694	P0DN24	101 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	GAGE1	Q13065	139 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	GAGE4	Q13068	117 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	GAGE5	Q13069	117 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	GAGE13	Q4V321	117 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	PSG8	Q9UQ74	426 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	SMUG1	Q53HV7	270 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	PARL	Q9H300	379 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	IGLV2-11	P01706	119 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	LINC01620	Q4KN68	170 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	TOR2A	Q5JU69	321 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	PRNT	Q86SH4	94 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	STAG3L2	P0CL84	134 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	STAG3L3	P0CL85	134 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	IFITM3	Q01628	133 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	SCX	Q7RTU7	201 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	BAALC	Q8WXS3	180 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760		A8MWV9	139 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	GGTLC3	B5MD39	225 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	GCHFR	P30047	84 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PEX10-208	ENST00000515760	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760		Q9UF83	564 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	SUN5	Q8TC36	379 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	RAB24	Q969Q5	203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	EPDR1	Q9UM22	224 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	COX11	Q9Y6N1	276 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760		A0A087WWC5	75 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	RMI2	Q96E14	147 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	JPT2	Q9H910	190 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	ASIP	P42127	132 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	LINC00479	Q96M42	142 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760		H3BVH4	76 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		13.72	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	CXorf1	O96002	111 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	NIT1	Q86X76	327 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760		Q8N976	141 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	IL36B	Q9NZH7	164 aa		13.71	□□□□□ -0.21
PEX10-208	ENST00000515760	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		13.71	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	RHOD	O00212	210 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	KLK12	Q9UKR0	248 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	MB	P02144	154 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	UBE2W	Q96B02	151 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760		B4DEV8	164 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	DEFA1	P59665	94 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	DEFA3	P59666	94 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760		Q86TA4	180 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	SYT8	Q8NBV8	401 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		13.68	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760		A0A1W2PRE2	83 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	SERF2	P84101	59 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PEX10-208	ENST00000515760		A0A087WX48	190 aa		13.66	□□□□□ -0.22

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