RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMDT1Q9H4I9 107 aa2.22□□□□□ -2.05
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.22□□□□□ -2.05
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CKLFQ9UBR5 152 aa2.22□□□□□ -2.05
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LYSTQ99698 3801 aa2.22□□□□□ -2.05
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A1B0GW64 132 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF98A6NK75 572 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FABP5P3A8MUU1 101 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C9JAW5 83 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SULT1C4O75897 302 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HTR1AP08908 422 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBBP0CG47 229 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COL8A2P25067 703 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPL38P63173 70 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NDUFA5Q16718 116 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MORN2Q502X0 79 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AAED1Q7RTV5 226 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C3orf56Q8N813 242 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR10P1Q8NGE3 313 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TERB2Q8NHR7 220 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BORCS8Q96FH0 119 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SDF2Q99470 211 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MND1Q9BWT6 205 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 YIPF3Q9GZM5 350 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VCXQ9H320 206 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLCE1Q9P212 2302 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HIGD1AQ9Y241 93 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EXPH5Q8NEV8 1989 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa2.21□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FREM1Q5H8C1 2179 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRIFINA4D1Z8 144 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ARRDC5A6NEK1 342 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 COLCA2A8K830 154 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 B4DSR2 109 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C5orf58C9J3I9 102 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GABARAPH6UMI1 98 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIN1P1O15428 100 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR2T1O43869 369 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPYP01303 97 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SHBGP04278 402 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGKV1-16P04430 117 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MSMBP08118 114 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCTP09683 121 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 S100A4P26447 101 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AKR1C1Q04828 323 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf140Q5VVS0 124 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LYPD6Q86Y78 171 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR8D4Q8NGM9 314 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF563Q8TA94 476 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CANT1Q8WVQ1 401 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DYNLRB1Q9NP97 96 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC39A9Q9NUM3 307 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 U3KQ87 197 aa2.2□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A096LPI6 279 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC160A6NGH7 325 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 H3BQF6 201 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGHV3-7P01780 117 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 APOC1P02654 83 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 XCL1P47992 114 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 UBA52P62987 128 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MOBPQ13875 183 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MIAQ16674 131 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 Q5XG85 94 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMEM136Q6ZRR5 245 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CROCCP2Q86T23 111 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OR8I2Q8N0Y5 310 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C4orf33Q8N1A6 199 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP3R2Q96LZ3 170 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C2orf88Q9BSF0 95 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.18□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.18□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa2.18□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IRGMA1A4Y4 181 aa2.18□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ODAMA1E959 279 aa2.18□□□□□ -2.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C7orf66A4D0T2 115 aa2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms