RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa13.6□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 COX8CQ7Z4L0 72 aa13.6□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.6□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.6□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 TRGV3P03979 118 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF56Q15929 161 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 DSPP15924 2871 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 MUC6Q6W4X9 2439 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 NRACQ8N912 160 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 COX6B1P14854 86 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 TCF15Q12870 199 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 PRO1854Q9UHT4 67 aa13.59□□□□□ -0.23
GLIS1-202ENST00000628545 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 WT1P19544 449 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 HLA-DMBP28068 263 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SCGB3A1Q96QR1 104 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RNF7Q9UBF6 113 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 F5H768 121 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CD59P13987 128 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 MFAP4P55083 255 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RPS28P62857 69 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 POM121L12Q8N7R1 296 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RNF125Q96EQ8 232 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CADP27708 2225 aa13.58□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 RBAKDNA6NC62 111 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CNTFRP26992 372 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 EMP1P54849 157 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 C3orf36Q3SXR2 165 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PRSS33Q8NF86 280 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01600Q96MT4 127 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 I3L2K1 104 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF491Q8N8L2 437 aa13.57□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TRGV11A0A075B6L2 103 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PDE6HQ13956 83 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 UQCRQO14949 82 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 EBI3Q14213 229 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF292O60281 2723 aa13.56□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 A0A0J9YY99 117 aa13.55□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 H3BMM0 161 aa13.55□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV1-44P01699 117 aa13.55□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM219Q86XT9 240 aa13.55□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 UBE2WQ96B02 151 aa13.55□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00526Q96FQ7 95 aa13.55□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01620Q4KN68 170 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TEX22C9J3V5 150 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-30P01768 117 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 IGFL4Q6B9Z1 124 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZS46 218 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 CD3EP07766 207 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TEX36Q5VZQ5 186 aa13.54□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 PMVKQ15126 192 aa13.53□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 ELANEP08246 267 aa13.53□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 IL17RELQ6ZVW7 336 aa13.52□□□□□ -0.24
GLIS1-202ENST00000628545 H7C2G1 150 aa13.52□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 TOMM6Q96B49 74 aa13.52□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 ZGRF1Q86YA3 2104 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 SMIM2Q9BVW6 85 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 DKK4Q9UBT3 224 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 MED13Q9UHV7 2174 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 P0DMU3 169 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 FAM231AP0DMU4 169 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 FAM231CP0DMU5 169 aa13.51□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-33P01772 117 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 ATXN8Q156A1 80 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM200BQ69YZ2 307 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 CFHR4Q92496 578 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 S4R3C0 116 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 GATA4P43694 442 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 ERCC8Q13216 396 aa13.5□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 K7EIM0 57 aa13.49□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 ORMDL2Q53FV1 153 aa13.49□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 CRYGBP07316 175 aa13.49□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa13.49□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 IGFBPL1Q8WX77 278 aa13.49□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 IMUPQ9GZP8 106 aa13.49□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV4-39P01824 125 aa13.48□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.48□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 ASPMQ8IZT6 3477 aa13.48□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 ZFHX4Q86UP3 3567 aa13.48□□□□□ -0.25
GLIS1-202ENST00000628545 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms