RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 HBDP02042 147 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 UTF1Q5T230 341 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 MS4A6AQ9H2W1 248 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF702PQ9H963 129 aa4.67□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 H0YJW9 148 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 IGHG2P01859 326 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 INSL3P51460 131 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 SYNJ2BPP57105 145 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 RASL11AQ6T310 242 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1W2PPI3 338 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM213A2RRL7 107 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 APOMO95445 188 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 SMIM17P0DL12 118 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 HSD52Q0P140 79 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 Q8TAT8 98 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 OTORQ9NRC9 128 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 NOTCH1P46531 2555 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 CR1P17927 2039 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 K7EP13 123 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 DLX6P56179 175 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 WT1-ASQ06250 92 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.66□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 K7EMI3 77 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 PROP1O75360 226 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 ESDP10768 282 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00310P59036 64 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 PSG3Q16557 428 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 TTC9CQ8N5M4 171 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 SIGMAR1Q99720 223 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GV72 72 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 MFAP4P55083 255 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ZANQ9Y493 2812 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 OR11H12B2RN74 326 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 K7ERJ3 54 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 TAX1BP3O14907 124 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 Q8N9W7 124 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 OR11H2Q8NH07 326 aa4.65□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 M0R381 172 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 TOMM40O96008 361 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 CNTFRP26992 372 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 RBX1P62877 108 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 C15orf32Q32M92 178 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 DEFB125Q8N687 156 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 GP9P14770 177 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 HTN1P15515 57 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 Q86TA4 180 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 FXYD5Q96DB9 178 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 RNF125Q96EQ8 232 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF479Q96JC4 524 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 CITED1Q99966 193 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 COX8AP10176 69 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 PRR25Q96S07 402 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 P0C879 139 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 PCP2Q8IVA1 136 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF503Q96F45 646 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 C17orf77Q96MU5 243 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 C8orf49Q96NF6 230 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 C21orf62Q9NYP8 219 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 C9orf118A6NHY6 69 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 FAM223BA6NKX1 122 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 G3V4G9 280 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 CTRLP40313 264 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ETDBQ3ZM63 59 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 AMTNQ6UX39 209 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 FAM231DQ6ZW35 169 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 C2orf70A6NJV1 201 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM238C9JI98 176 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 E7EUB6 86 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 IGKCP01834 107 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 PATE2Q6UY27 113 aa4.63□□□□□ -1.67
SHQ1-205ENST00000468371 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 107.1 ms