RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 RAB26Q9ULW5 256 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 CIDEAO60543 219 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 HLA-DQA1P01909 254 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SEC11BP0C7V7 166 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 PDE6HQ13956 83 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SCGB3A2Q96PL1 93 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 MIXL1Q9H2W2 232 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.38□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 A0A087WX48 190 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 PGPEP1LA6NFU8 196 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SSSCA1O60232 199 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 CAMLGP49069 296 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 VBP1P61758 197 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 Q6ZRG5 221 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 OR10G9Q8NGN4 311 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 C20orf85Q9H1P6 137 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 VAX2Q9UIW0 290 aa7.37□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 CTDSPLO15194 276 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 ELOBQ15370 118 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 MZT2AQ6P582 158 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 NRARPQ7Z6K4 114 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.36□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 VAMP1P23763 118 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF506Q5JVG8 444 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00479Q96M42 142 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 GGACTQ9BVM4 153 aa7.35□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 RBAKDNA6NC62 111 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 DIRC3C9JPN6 131 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 H7C1H1 209 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SFT2D2O95562 160 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 NBEAP1P0C6P0 100 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 GCSAMLQ5JQS6 135 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 TVP23CQ96ET8 276 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SLC25A2Q9BXI2 301 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 MCUBQ9NWR8 336 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.34□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 PGPA6NDG6 321 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 PPP1R1AQ13522 171 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 PHYHIPLQ96FC7 376 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 PFDN5Q99471 154 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 PARLQ9H300 379 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 VCX3BQ9H321 246 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.33□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM262E9PQX1 116 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 TAAR5O14804 337 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 ASB13Q8WXK3 278 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 C9orf85Q96MD7 179 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 ATP5SQ99766 215 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 JPT2Q9H910 190 aa7.32□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 TRAV21A0A0B4J279 112 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 CTDSP2O14595 271 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 TSC22D2O75157 780 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 PRR4Q16378 134 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 ZFP2Q6ZN57 461 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 PTH2Q96A98 100 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 FXYD5Q96DB9 178 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.31□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 hDV102S1A0JD36 115 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 C7orf66A4D0T2 115 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 F6UZH7 168 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 CRPP02741 224 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 TAS2R30P59541 319 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 RANP62826 216 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 COX6A2Q02221 97 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 MPV17L2Q567V2 206 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 KCNS1Q96KK3 526 aa7.3□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 FAM231BA6NCW3 169 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 CSN1S1P47710 185 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 MIAQ16674 131 aa7.29□□□□□ -1.24
DDX39B-208ENST00000428098 MAJINQ3KP22 176 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117 ms