RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 IL7P13232 177 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 GCSHP23434 173 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 ATP6V1FQ16864 119 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 MDFICQ9P1T7 246 aa11.51□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 NBEAP1P0C6P0 100 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 SFTA3P0C7M3 94 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 ZNF138P52744 262 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 MUC21Q5SSG8 566 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.5□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 MYCBP2O75592 4640 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 FAM229AH3BQW9 127 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 K7EP13 123 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 GYPEP15421 78 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 RAB32Q13637 225 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 Q8TAT8 98 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 ZNF479Q96JC4 524 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 OR51M1Q9H341 326 aa11.49□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 TCRBP04435 133 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 IQCF2Q8IXL9 164 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.48□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 PLA2G10O15496 165 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 LYRM1O43325 122 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 ORM1P02763 201 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 CRYGDP07320 174 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 HAMPP81172 84 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 THAP6Q8TBB0 222 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 PAXXQ9BUH6 204 aa11.47□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 OR10J4P0C629 311 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 CSN1S1P47710 185 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 TMEM183BQ1AE95 376 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 TMEM183AQ8IXX5 376 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 RASL10AQ92737 203 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 TXNDC17Q9BRA2 123 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 SPXQ9BT56 116 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.46□□□□□ -0.57
CS-214ENST00000548849 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 PSCAO43653 123 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 IL15RAQ13261 267 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 ZNF266Q14584 549 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 FAM159AQ6UWV7 190 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 FXYD5Q96DB9 178 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 PHYHIPLQ96FC7 376 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 NUDT15Q9NV35 164 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 C9JCJ5 164 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 RANP62826 216 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 NHLH2Q02577 135 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.44□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 RBAKDNA6NC62 111 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 H2AFB2P0C5Z0 115 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 Q6ZSN1 163 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 OR4C5Q8NGB2 326 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 NAGKQ9UJ70 344 aa11.43□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 TRAV4A0A0B4J268 109 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 OR7C2O60412 319 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 Q6AWC8 147 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.42□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 PPT1P50897 306 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 TMEM70Q9BUB7 260 aa11.41□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 DIRC3C9JPN6 131 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 J3QL48 77 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 GNRH2O43555 120 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 KCNIP2Q9NS61 270 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 LENEPQ9Y5L5 61 aa11.4□□□□□ -0.58
CS-214ENST00000548849 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 C17orf112F2Z3M2 114 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 M0R2P5 195 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 HYLS1Q96M11 299 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 Q9HAA7 133 aa11.39□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 TDRG1Q3Y452 100 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 Q8N814 137 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 RPH3ALQ9UNE2 315 aa11.38□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 TIRAPP58753 221 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 OR10J3Q5JRS4 329 aa11.37□□□□□ -0.59
CS-214ENST00000548849 OR5AC2Q9NZP5 309 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms