RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	VPS13C	Q709C8	3753 aa		4.76	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GV50	99 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1B0GW64	132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SSSCA1	O60232	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SIX6	O95475	246 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	OXT	P01178	125 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-11	P01762	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	OPRK1	P41145	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TIGIT	Q495A1	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	THAP8	Q8NA92	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	MTOR	P42345	2549 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRBV7-1	A0A0A6YYK4	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYCNOS	P40205	109 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSG9	Q00887	426 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C15orf32	Q32M92	178 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q56UQ5	140 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	STPG4	Q8N801	248 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	NMES1	Q9C002	83 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	VSIR	Q9H7M9	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	LINC01619	G3V211	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		H3BP45	60 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCL24	O00175	119 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPRY2	O43597	315 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV3-23	P01764	117 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGLC1	P0CG04	106 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC25A4	P12235	298 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACY3	Q96HD9	319 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		S4R3C0	116 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C7orf71	A4D174	169 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		B4DEV8	164 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	RHOD	O00212	210 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	NDUFC2	O95298	119 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	GPR183	P32249	361 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	MFAP2	P55001	183 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	H2BFS	P57053	126 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLK9	Q2XQG4	91 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q9H8V8	135 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q9UF83	564 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ECHDC1-208	ENST00000436638	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A087WW49	117 aa		4.71	□□□□□ -1.66
ECHDC1-208	ENST00000436638	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.71	□□□□□ -1.66

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