RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428098.5

DDX39B-208, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-208ENST00000428098 Q9UF83 564 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.48□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 A0A087WYN8 130 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 GOSR2O14653 212 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 COX7A2P2O60397 106 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 C14orf177Q52M58 125 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 NIT1Q86X76 327 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 Q8TAT8 98 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-208ENST00000428098 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 DISC1C4P0D8 188 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 USP17L23D6RBM5 183 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 AGPAT2O15120 278 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 OR10J4P0C629 311 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 SLC25A6P12236 298 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 RHOHQ15669 191 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 NEDD8Q15843 81 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 BAK1Q16611 211 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM78Q5T7P6 136 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 YIPF6Q96EC8 236 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 C2orf50Q96LR7 162 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 FAM25AB3EWG3 89 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 FAM25CB3EWG5 89 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 FAM25GB3EWG6 89 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 CHTF8P0CG12 524 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF266Q14584 549 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF546Q86UE3 836 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 DPH3Q96FX2 82 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 PRELID1Q9Y255 219 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 LINC00694P0DN24 101 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF138P52744 262 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ID3Q02535 119 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ARL16Q0P5N6 197 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 IZUMO2Q6UXV1 221 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 MGST2Q99735 147 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 SOSTQ9BQB4 213 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 GAGE12JA6NER3 117 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 SRPXP78539 464 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 GAGE1Q13065 139 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 GAGE4Q13068 117 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 GAGE5Q13069 117 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 GAGE13Q4V321 117 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 Q6AWC8 147 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ENHOQ6UWT2 76 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 PSENENQ9NZ42 101 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 C5orf51A6NDU8 294 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 FNDC10F2Z333 226 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 PYYP10082 97 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 PRRT1Q99946 306 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 OR51M1Q9H341 326 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.42□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 AKAIN1P0CW23 69 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ANXA3P12429 323 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 ZNF876PQ49A33 203 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 MIC13Q5XKP0 118 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 REG3GQ6UW15 175 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 NAGKQ9UJ70 344 aa7.41□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 TYMSP04818 313 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 HOXB5P09067 269 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 INPP1P49441 399 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 NCS1P62166 190 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 RPL19P84098 196 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 RAB31Q13636 194 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 RNF185Q96GF1 192 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 SMIM8Q96KF7 97 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.4□□□□□ -1.22
DDX39B-208ENST00000428098 A0A087WWC5 75 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SLPIP03973 132 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 MGST1P10620 155 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 CAV2P51636 162 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 Q0VG73 95 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 C7orf33Q8WU49 177 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 GTSF1Q8WW33 167 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 SH3BGRL3Q9H299 93 aa7.39□□□□□ -1.23
DDX39B-208ENST00000428098 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.2 ms