RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028157.8

Gtf3c5-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20773A0A0A6YXW2 232 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20807A0A0A6YXX7 232 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 BC053393A0A0B4J1F6 192 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr912A0A1L1SSS5 310 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1248A0A1L1SSZ5 307 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15217A2CG07 155 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4930444P10RikD3YUR1 185 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20873J3QMQ9 232 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20795J3QP49 232 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21310J3QQ23 232 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm8653K9J7G2 307 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r117L7N2C9 307 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tnfaip6O08859 275 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Cd74P04441 279 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Q08AU9 97 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21440Q3TTD8 232 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arg1Q61176 323 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1295Q8VF48 312 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr492Q8VFD1 314 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr786Q8VFH8 312 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 GrhprQ91Z53 328 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pxmp4Q9JJW0 212 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm12728V9GX31 77 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dopey1Q8BL99 2399 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ahctf1Q8CJF7 2243 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-26A0A075B5V0 117 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv1-19A0A0A6YWX0 117 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 E430018J23RikE9PZQ8 461 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20767O70517 169 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P04942 107 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl31P62900 125 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Arrdc5Q497K5 325 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Znrd1Q791N7 123 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 4922502D21RikQ8C634 189 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Acaa1bQ8VCH0 424 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1269Q8VEZ2 309 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1265Q8VEZ3 309 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr513Q8VFZ3 309 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr770Q8VGC2 311 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sfxn4Q925N1 313 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 NanpQ9CPT3 248 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Try5Q9QUK9 246 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Try4Q9R0T7 246 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vsig2Q9Z109 328 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 G6pc2Q9Z186 355 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lama5Q61001 3718 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ighv8-9A0A0G2JET1 119 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20825J3QM67 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ccl2P10148 148 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Klk1b22P15948 259 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P18529 117 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rab19P35294 217 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ssty2Q149W4 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm21394Q497R7 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 C1ql4Q4ZJM9 238 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm20854Q62461 227 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 EtdQ80SW5 59 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15127B1AVZ5 449 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm15091B1AZM2 449 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nkx2-8O70584 235 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ca2P00920 260 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01788 123 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Meox2P32443 303 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Hmx3P42581 356 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ube2g2P60605 165 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1386Q7TQT0 309 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Slc25a16Q8C0K5 332 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Nabp2Q8R2Y9 212 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tmem170aQ9D342 144 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sh2d6Q9D413 297 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1328B1ARV2 313 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sesn1P58006 492 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Tppp2Q0P5Y3 170 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr132Q7TRI8 313 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Exosc2Q8VBV3 293 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr1457Q8VFK3 317 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr344Q8VFP9 309 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Sh3bgrl3Q91VW3 93 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mad2l1bpQ9DCX1 276 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Olfr282A1L1B4 308 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Pfdn2O70591 154 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 P01783 136 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 KncnQ307W7 124 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 FibinQ9CQS3 217 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Fam241aQ9CZL2 131 aa11.11□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Smg1Q8BKX6 3658 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm28845A0A087WR76 214 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Trbv13-3A0A0B4J1H2 113 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Vmn1r224E9PWK2 298 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Gm10665K7N6B7 321 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Mef2bO55087 349 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Oprk1P33534 380 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Rpl23P62830 140 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zfp386Q1WWJ5 626 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 HrasQ61411 189 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Ankrd33Q8BXP5 385 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Zim1Q8C393 579 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lrrc20Q8CI70 184 aa11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Lsm4Q9QXA5 137 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 Dvl1P51141 695 aa11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 12.6 ms