RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WTM6	91 aa		8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	PAX4	O43316	350 aa		8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF253	O75346	499 aa		8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	CST7	O76096	145 aa		8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	MITD1	Q8WV92	249 aa		8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL53	Q96EL3	112 aa	Known RBP	8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		8.11	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV2-40	A0A087WW87	121 aa	Predicted RBP	8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	IGKV2D-40	P01614	121 aa	Predicted RBP	8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	PYY	P10082	97 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	HAMP	P81172	84 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIQK	Q629K1	86 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZRG5	221 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	C8orf49	Q96NF6	230 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	8.1	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	EREG	O14944	169 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	MPDU1	O75352	247 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	CRISP2	P16562	243 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	CAV2	P51636	162 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYBA4	P53673	196 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	FHL2	Q14192	279 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	VWC2	Q2TAL6	325 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	FRZB	Q92765	325 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	PFDN5	Q99471	154 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	VGLL1	Q99990	258 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	PRO0255	Q9UI72	69 aa		8.09	□□□□□ -1.11
TTLL3-233	ENST00000602338	IGSF23	A1L1A6	192 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338		L7N2F9	121 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	PRAF2	O60831	178 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	GPX1	P07203	203 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	INPP1	P49441	399 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	BCAP31	P51572	246 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	VAMP2	P63027	116 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB31	Q13636	194 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	BLNK	Q8WV28	456 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00477	Q96M19	166 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		8.08	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC160	A6NGH7	325 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS13	O14921	159 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	BAX	Q07812	192 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	PDE6H	Q13956	83 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	ICAM4	Q14773	271 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	NFE4	Q86UQ8	179 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338		Q8TAT8	98 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		8.07	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM25E	A8MYX2	175 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338		K7EQD1	137 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	SFTA3	P0C7M3	94 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF479	Q96JC4	524 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	PRELID1	Q9Y255	219 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		8.06	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338		E5RGE8	158 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	IFNA5	P01569	189 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	NMB	P08949	121 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	IL7	P13232	177 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF7	P21781	194 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	SULT1A1	P50225	295 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF846	Q147U1	533 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF492	Q9P255	531 aa		8.05	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPX	A8MT69	81 aa		8.04	□□□□□ -1.12
TTLL3-233	ENST00000602338	PLA2G10	O15496	165 aa		8.04	□□□□□ -1.12

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms