RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 RANP62826 216 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 RPL23P62829 140 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 C6orf99Q4VX62 202 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 GLT8D1Q68CQ7 371 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 FAM231DQ6ZW35 169 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 CYGBQ8WWM9 190 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 ASB17Q8WXJ9 295 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-217ENST00000509355 PP6455Q8WZ26 134 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 RNF5Q99942 180 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 TMEM243Q9BU79 118 aa2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
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PDE4D-217ENST00000509355 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 OR5H14A6NHG9 310 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 SULT1C4O75897 302 aa2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 IGLV2-23P01705 113 aa2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 TMEM144Q7Z5S9 345 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 TMEM101Q96IK0 257 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 TCEAL7Q9BRU2 100 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 SLC25A31Q9H0C2 315 aa2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 HSPB11Q9Y547 144 aa2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 R4GMQ9 66 aa2.9□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 SMIM6P0DI80 62 aa2.89□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 CRISP2P16562 243 aa2.89□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 SULT1A2P50226 295 aa2.89□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 TMEM183AQ8IXX5 376 aa2.89□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.88□□□□□ -1.95
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PDE4D-217ENST00000509355 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 APOA2P02652 100 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 CD5P06127 495 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 CCL1P22362 96 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 PRSS3P35030 304 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 NMUP48645 174 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 TCL1AP56279 114 aa2.88□□□□□ -1.95
PDE4D-217ENST00000509355 RSU1Q15404 277 aa2.88□□□□□ -1.95
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