RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 LINC01549A6NIU2 74 aa9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 GATD1Q8NB37 220 aa9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 A0A087WW49 117 aa9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IL17DQ8TAD2 202 aa9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 HELZP42694 1942 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 WNK2Q9Y3S1 2297 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 Q86TA4 180 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 TMEM243Q9BU79 118 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 PLXNA2O75051 1894 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IGKV1-39P01597 117 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IGKV1D-39P04432 117 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 WT1-ASQ06250 92 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 ATP6V0BQ99437 205 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 DERL1Q9BUN8 251 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IGHV4-31P0DP07 118 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 ADMP35318 185 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 PAX2Q02962 417 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 FNDC10F2Z333 226 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IGKCP01834 107 aa9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 PFN1P07737 140 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 PTPRDP23468 1912 aa9.55□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 RASL11AQ6T310 242 aa9.55□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 SMKR1H3BMG3 65 aa9.55□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.55□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 GGTLC3B5MD39 225 aa9.55□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 F6UB75 175 aa9.55□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 AJUBAQ96IF1 538 aa9.55□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 A0A1B0GV72 72 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 ESM1Q9NQ30 184 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZQT7 251 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 H3BRN7 92 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 UBE2BP63146 152 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 DEFB135Q30KP9 77 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 TRBV19A0A075B6N1 114 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IGLL5B9A064 214 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 SHISA2Q6UWI4 295 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.54□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 NIT1Q86X76 327 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 SPXQ9BT56 116 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 PRIMA1Q86XR5 153 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 C14orf144Q96I85 54 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 DEFB4AO15263 64 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 ATP5G1P05496 136 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 SFTA2Q6UW10 78 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 TMEM75Q8N9X5 138 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 C4orf3Q8WVX3 66 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 C8orf31Q8N9H6 132 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 U3KQE9 123 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 SMIM6P0DI80 62 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 RHOHQ15669 191 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 PRR25Q96S07 402 aa9.53□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.52□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.52□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa9.52□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.52□□□□□ -0.88
NEK1-201ENST00000439128 PRSS57Q6UWY2 283 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 LINC00479Q96M42 142 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 COL4A3Q01955 1670 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 SERF1AO75920 110 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 LY6G5BQ8NDX9 201 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 H3BMM0 161 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 I3L3M4 83 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 UBE2WQ96B02 151 aa9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 A0A1B0GW64 132 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 VWC2LB2RUY7 222 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 AMN1Q8IY45 258 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 M0R2P5 195 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 OR2K2Q8NGT1 345 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 GTF3C1Q12789 2109 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 C1orf43Q9BWL3 253 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 GNB1LQ9BYB4 327 aa9.51□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 IGHV3-30P01768 117 aa9.5□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 IGHV3-33P01772 117 aa9.5□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.5□□□□□ -0.89
NEK1-201ENST00000439128 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.8 ms