RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362954.1

RNU6-199P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 199, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-199P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-199P-201ENST00000362954 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-199P-201ENST00000362954 TECPR2O15040 1411 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-199P-201ENST00000362954 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-199P-201ENST00000362954 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-199P-201ENST00000362954 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa0.09□□□□□ -2.39
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 A6NN06 94 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 H7BYZ3 331 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 IGHV3-30P01768 117 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 FABP4P15090 132 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 CRYBA4P53673 196 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 NEDD8Q15843 81 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 C3orf33Q6P1S2 294 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 CROCCP2Q86T23 111 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 ANGPTL5Q86XS5 388 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 C10orf111Q8N326 155 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 OR4B1Q8NGF8 309 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 DYDC1Q8WWB3 177 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 DIRC1Q969H9 104 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 MCEEQ96PE7 176 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 JPT1Q9UK76 154 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 SYNMO15061 1565 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 ANK1P16157 1881 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 NINQ8N4C6 2090 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 KNTC1P50748 2209 aa0.09□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 CACNA1EQ15878 2313 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRPM7Q96QT4 1865 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 E5RI56 91 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 PPP5D1E7EU14 171 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 GABARAPH6UMI1 98 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRACP01848 142 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 FABP2P12104 132 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 KDELR1P24390 212 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 G0S2P27469 103 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 SERPINB1P30740 379 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 GNG10P50151 68 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 DCUN1D2Q6PH85 259 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 C10orf99Q6UWK7 81 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 CASC2Q6XLA1 102 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 C5orf17Q8NAS9 161 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 OR5H6Q8NGV6 325 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 GRPEL2Q8TAA5 225 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 ISOC1Q96CN7 298 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 LPAR5Q9H1C0 372 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 USP54Q70EL1 1684 aa0.08□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 ROCK1Q13464 1354 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 C5orf58C9J3I9 102 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 SULT1C4O75897 302 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 BCL2P10415 239 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TPT1P13693 172 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 S100A11P31949 105 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 SDC2P34741 201 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 CAV3P56539 151 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 FXYD6P3P58550 94 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TMEM78Q5T7P6 136 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRIQKQ629K1 86 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 CSAG1Q6PB30 78 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 IZUMO2Q6UXV1 221 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 LINC00305Q7Z4B0 112 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TMEM229BQ8NBD8 167 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 OR5AK2Q8NH90 309 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 CLEC2BQ92478 149 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 PRELID3AQ96N28 172 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 NABP2Q9BQ15 211 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 DSPPQ9NZW4 1301 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 NAV2Q8IVL1 2488 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 BCORL1Q5H9F3 1711 aa0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP0.07□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 A0A1W2PRE2 83 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 LY6G6CO95867 125 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 GYPBP06028 91 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 EVI2AP22794 236 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 NDUFA6P56556 154 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 MAXP61244 160 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 QRFPP83859 136 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 GLYATL3Q5SZD4 288 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 XAF1Q6GPH4 301 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 HRCT1Q6UXD1 115 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 DEFB132Q7Z7B7 95 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 STX12Q86Y82 276 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TEX29Q8N6K0 151 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa0.06□□□□□ -2.4
RNU6-199P-201ENST00000362954 TSKUQ8WUA8 353 aa0.06□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms