RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 OR10J4P0C629 311 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 GCHFRP30047 84 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 MEOX2P50222 304 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PAFAH1B2P68402 229 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CLLU1Q5K131 121 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 MORN5Q5VZ52 161 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SSX7Q7RTT5 188 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 TCF24Q7RTU0 167 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 U3KQE9 123 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 J3QL48 77 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 NMBP08949 121 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 PYYP10082 97 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 GUK1Q16774 197 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SYT8Q8NBV8 401 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 BLNKQ8WV28 456 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF183Q96D59 192 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 MANBALQ9NQG1 85 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 C16orf90A8MZG2 172 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 CSN3P07498 182 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SAMD13Q5VXD3 122 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 GLMPQ8WWB7 406 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 AAMDCQ9H7C9 122 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 GNG13Q9P2W3 67 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-209ENST00000590049 RNF213Q63HN8 5207 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PSG9Q00887 426 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PDE6HQ13956 83 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CST9LP1Q5W188 147 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 FXYD5Q96DB9 178 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 SLC50A1Q9BRV3 221 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TUBA4BQ9H853 241 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A087X0K7 114 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 IGLC2P0DOY2 106 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 EDN2P20800 178 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ID1P41134 155 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 UBE2G2P60604 165 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF503Q96F45 646 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 C16orf92Q96LL3 132 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 NRN1Q9NPD7 142 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 MLXQ9UH92 298 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.57□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TRBV19A0A075B6N1 114 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BTX0 84 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF253O75346 499 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 RANP62826 216 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 LCN12Q6JVE5 192 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 LYPD1Q8N2G4 141 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 GBGT1Q8N5D6 347 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF586Q9NXT0 402 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.56□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 A0A1W2PRE2 83 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 RBFOX3A6NFN3 312 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 OR4C46A6NHA9 309 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BQ15 152 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PAGE4O60829 102 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 BCL2P10415 239 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CSN1S1P47710 185 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TFPI2P48307 235 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CCL20P78556 96 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PEA15Q15121 130 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 GUCA2BQ16661 112 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 NDUFA5Q16718 116 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TOR2AQ5JU69 321 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM210AQ96ND0 272 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 Q9H3A6 140 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 VAX2Q9UIW0 290 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.55□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 PGPA6NDG6 321 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM74A7A6NL05 159 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 C11orf94C9JXX5 98 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 F6UZH7 168 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 TSPAN4O14817 238 aa8.54□□□□□ -1.04
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.54□□□□□ -1.04
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