RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	GALR1	P47211	349 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	FXYD7	P58549	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	PLP1	P60201	277 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	BLNK	Q8WV28	456 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	ASB13	Q8WXK3	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	NEU1	Q99519	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CS-233	ENST00000552688	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		H3BQ15	152 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SOCS3	O14543	225 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PFDN1	O60925	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	MPDU1	O75352	247 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF266	Q14584	549 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PFDN5	Q99471	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		A0A1B0GV50	99 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	BCL2L11	O43521	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	OR7C2	O60412	319 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TMUB2	Q71RG4	321 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF738	Q8NE65	137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	OR10G9	Q8NGN4	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	OR10G7	Q8NGN6	311 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FUT9	Q9Y231	359 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	IGLV2-18	A0A075B6J9	118 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		A0A1W2PPV4	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		H3BMM0	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	IGLC2	P0DOY2	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ID1	P41134	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PSMB3	P49720	205 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZFP69	Q49AA0	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF575	Q86XF7	245 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	PAXX	Q9BUH6	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	AGRN	O00468	2067 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		A0A087X0K7	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HMSD	A8MTL9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688		M0R3E3	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	C1QB	P02746	253 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	HLA-DRB4	P13762	266 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	M6PR	P20645	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	S100A7	P31151	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	FHIT	P49789	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	RHOB	P62745	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF345	Q14585	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CS-233	ENST00000552688	TMED6	Q8WW62	240 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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