RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 A8MZ25 164 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 K7EIL1 84 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 IFNA1P01562 189 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 PMS2P11Q13670 270 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 ICAM4Q14773 271 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 EBLN2Q6P2I7 272 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 C20orf173Q96LM9 149 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa8.49□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
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ARHGEF3-211ENST00000486829 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 FAM74A7A6NL05 159 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 HLA-DRB4P13762 266 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 RAB14P61106 215 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGFL4Q6B9Z1 124 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEFB125Q8N687 156 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 TUBA4BQ9H853 241 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa8.48□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 A0A0J9YX75 114 aa8.47□□□□□ -1.05
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ARHGEF3-211ENST00000486829 PGPA6NDG6 321 aa8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACTL10Q5JWF8 245 aa8.47□□□□□ -1.05
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ARHGEF3-211ENST00000486829 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.47□□□□□ -1.05
ARHGEF3-211ENST00000486829 GGTLC3B5MD39 225 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 K7EQM0 130 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 M0R3E3 92 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 HLA-DMBP28068 263 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 UBE2G2P60604 165 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 CST9LP1Q5W188 147 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 HIST1H2BAQ96A08 127 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 GNG13Q9P2W3 67 aa8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
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ARHGEF3-211ENST00000486829 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 KNCNA6PVL3 124 aa8.45□□□□□ -1.06
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ARHGEF3-211ENST00000486829 F6UZH7 168 aa8.45□□□□□ -1.06
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ARHGEF3-211ENST00000486829 NMBP08949 121 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 BCL2P10415 239 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCL20P78556 96 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF124Q15973 351 aa8.45□□□□□ -1.06
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ARHGEF3-211ENST00000486829 ATG101Q9BSB4 218 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 EPDR1Q9UM22 224 aa8.45□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 A8MTW9 85 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 C11orf94C9JXX5 98 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 PRAC2D3DTV9 90 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 F6UB75 175 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 CNN1P51911 297 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 APOC4P55056 127 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 IFITM2Q01629 132 aa8.44□□□□□ -1.06
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ARHGEF3-211ENST00000486829 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00477Q96M19 166 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 ODF3Q96PU9 254 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 VAX2Q9UIW0 290 aa8.44□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 RGS13O14921 159 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 PDE6DO43924 150 aa8.43□□□□□ -1.06
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ARHGEF3-211ENST00000486829 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 CLLU1Q5K131 121 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM78Q5T7P6 136 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR4B1Q8NGF8 309 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.43□□□□□ -1.06
ARHGEF3-211ENST00000486829 AGRNO00468 2067 aa8.42□□□□□ -1.06
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