RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	RAB2A	P61019	212 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ODF3	Q96PU9	254 aa		10.63	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0J9YWU9	116 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	SMLR1	H3BR10	107 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241		H3BTX0	84 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241		Q8NAQ8	132 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	BLNK	Q8WV28	456 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	RFNG	Q9Y644	331 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	OR10J4	P0C629	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	STAG3L2	P0CL84	134 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	STAG3L3	P0CL85	134 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	TSPO	P30536	169 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241		X6R8D5	127 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM189	A5PLL7	270 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	RBAKDN	A6NC62	111 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	BCL2L11	O43521	198 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	INS	P01308	110 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	CDKN1B	P46527	198 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	SUN5	Q8TC36	379 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	RAB24	Q969Q5	203 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	LINC00477	Q96M19	166 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	CXorf1	O96002	111 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	C1QB	P02746	253 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	CSN1S1	P47710	185 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	ICAM4	Q14773	271 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	CASC10	Q5T4H9	136 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241		Q9H3A6	140 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	OTOR	Q9NRC9	128 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PTPA-222	ENST00000445241	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	PRAC2	D3DTV9	90 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241		M0R2Z0	102 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241		M0R3E3	92 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	SEC11B	P0C7V7	166 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	LEP	P41159	167 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	FXYD7	P58549	80 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	AKAP14	Q86UN6	197 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	HYLS1	Q96M11	299 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		10.58	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	UMAD1	C9J7I0	102 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	NMB	P08949	121 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TMUB2	Q71RG4	321 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	STOML3	Q8TAV4	291 aa		10.57	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	HBE1	P02100	147 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	GCHFR	P30047	84 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	BAP18	Q8IXM2	172 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TMED6	Q8WW62	240 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		10.55	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	CT45A10	P0DMU9	189 aa		10.55	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	CRISP2	P16562	243 aa		10.55	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	RRN3P1	Q2M238	152 aa		10.55	□□□□□ -0.72
PTPA-222	ENST00000445241	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		10.55	□□□□□ -0.72

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