RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365200.1

RNU6-1175P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1175, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1175P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TVP23BQ9NYZ1 205 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GUCA1BQ9UMX6 200 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ASB4Q9Y574 426 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NUP210LQ5VU65 1888 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A087WUJ7 227 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TRAV4A0A0B4J268 109 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A0J9YY99 117 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CLDN24A6NM45 220 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SLC16A4O15374 487 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DCTN3O75935 186 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HAND1O96004 215 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IGHV3-33P01772 117 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CRHP06850 196 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C8GP07360 202 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MPC1LP0DKB6 136 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HLA-EP13747 358 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IDO1P14902 403 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 INSL3P51460 131 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMBIM6P55061 237 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARPP19P56211 112 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VBP1P61758 197 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MYL5Q02045 173 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KLRD1Q13241 179 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MED21Q13503 144 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MSMO1Q15800 293 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BCL2L15Q5TBC7 163 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LYRM7Q5U5X0 104 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FAM9CQ8IZT9 166 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CLDN22Q8N7P3 220 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ARL5BQ96KC2 179 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ZNF714Q96N38 554 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GLTPQ9NZD2 209 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPTA1P02549 2419 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KIF1BO60333 1816 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ANK1P16157 1881 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SOGA1O94964 1423 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C9orf84Q5VXU9 1444 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A096LNT2 108 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 J3QRK9 145 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 RER1O15258 196 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LYPLA2O95372 231 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IGHV3-30P01768 117 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NMBP08949 121 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 AP3S2P59780 193 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 POU6F1Q14863 301 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HIST3H3Q16695 136 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IQCJQ1A5X6 159 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IDO2Q6ZQW0 420 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LINC00269Q8N2A0 174 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 YPEL2Q96QA6 119 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PRR15LQ9BU68 103 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IMUPQ9GZP8 106 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 COMMD3Q9UBI1 195 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 VPS29Q9UBQ0 182 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NINQ8N4C6 2090 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CHD8Q9HCK8 2581 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 UNC13BO14795 1591 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CPDO75976 1380 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A0A0A6YYH2 397 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 A6NJ64 397 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 PDE6DO43924 150 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 BANF1O75531 89 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IFNA5P01569 189 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IGKCP01834 107 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TFF1P04155 84 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IFNA16P05015 189 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NFYBP25208 207 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 ERP29P30040 261 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SPAG11BQ08648 103 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 EDDM3AQ14507 147 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 SNCBQ16143 134 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 HACD4Q5VWC8 232 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 NAT14Q8WUY8 206 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CST11Q9H112 138 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-1175P-201ENST00000365200 TMEM14BQ9NUH8 114 aa-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms