RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.94□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 DKK2Q9UBU2 259 aa14.94□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa14.93□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 PRAC2D3DTV9 90 aa14.93□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 PTTG1O95997 202 aa14.93□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.93□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 ZNF586Q9NXT0 402 aa14.93□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 MPC2O95563 127 aa14.92□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 PET100P0DJ07 73 aa14.92□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.92□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa14.92□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.92□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.92□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 PRM2P04554 102 aa14.91□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 TMEM14CQ9P0S9 112 aa14.91□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 TRBV19A0A075B6N1 114 aa14.9□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 ZNF253O75346 499 aa14.9□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 HTN3P15516 51 aa14.9□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 CDKN1BP46527 198 aa14.9□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 LINC01587Q99440 93 aa14.9□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 ATP5SQ99766 215 aa14.9□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.9□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 HSPB11Q9Y547 144 aa14.9□□□□□ -0.02
CITED1-201ENST00000246139 RYR1P21817 5038 aa14.89□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.89□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 PYYP10082 97 aa14.89□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 TMEM256Q8N2U0 113 aa14.89□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 TIMM9Q9Y5J7 89 aa14.89□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 ALG5Q9Y673 324 aa14.89□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 RPL12P30050 165 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 OXA1LQ15070 435 aa14.88□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 RGS21Q2M5E4 152 aa14.88□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 MIR17HGQ75NE6 70 aa14.88□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.88□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 MBD2Q9UBB5 411 aa14.88□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 HTN1P15515 57 aa14.87□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 AZU1P20160 251 aa14.87□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 TSPOP30536 169 aa14.87□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 DAD1P61803 113 aa14.87□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 BLNKQ8WV28 456 aa14.87□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.87□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 DNAH17Q9UFH2 4485 aa14.86□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 NDUFB4O95168 129 aa14.86□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 P0DMU3 169 aa14.86□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 FAM231AP0DMU4 169 aa14.86□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 FAM231CP0DMU5 169 aa14.86□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 TAS2R60P59551 318 aa14.86□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 NPIPB6E9PJ23 425 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 IFNA5P01569 189 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 CT45A10P0DMU9 189 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 PDE6HQ13956 83 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 KIR3DS1Q14943 382 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 SCGB1C1Q8TD33 95 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 OR51M1Q9H341 326 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 PRELID1Q9Y255 219 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.85□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 DNAH2Q9P225 4427 aa14.84□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 LYRM9A8MSI8 78 aa14.84□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 M0R3E3 92 aa14.84□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 LEPP41159 167 aa14.84□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.84□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 FAM210BQ96KR6 192 aa14.84□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.84□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 FUT9Q9Y231 359 aa14.84□□□□□ -0.03
CITED1-201ENST00000246139 H7BYZ3 331 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 J3KRW8 73 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 FFAR4Q5NUL3 377 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 POM121L12Q8N7R1 296 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 C16orf74Q96GX8 76 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 ODF3Q96PU9 254 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 PAXXQ9BUH6 204 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 AAMDCQ9H7C9 122 aa14.83□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 PLAC8L1A1L4L8 177 aa14.82□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.82□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 DEFB130BP0DP73 79 aa14.82□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 DEFB130AP0DP74 79 aa14.82□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 ERCC8Q13216 396 aa14.82□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 MED28Q9H204 178 aa14.82□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 WFDC1Q9HC57 220 aa14.82□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 PKHD1P08F94 4074 aa14.82□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 ICAM4Q14773 271 aa14.81□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 FCN2Q15485 313 aa14.81□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.81□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 RNF141Q8WVD5 230 aa14.81□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 OR10J4P0C629 311 aa14.8□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 FAM122CQ6P4D5 195 aa14.8□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 ZNF493Q6ZR52 646 aa14.8□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 FXYD5Q96DB9 178 aa14.8□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa14.79□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 OR7C2O60412 319 aa14.79□□□□□ -0.04
CITED1-201ENST00000246139 TMEM88Q6PEY1 159 aa14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms