RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550649.5

NUBPL-208, Transcript of nucleotide binding protein like, human

TSL 5

Gene NUBPL, Length 557 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUBPL-208	ENST00000550649		A0A0J9YX75	114 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	SLC17A3	O00476	420 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	IGLC2	P0DOY2	106 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	FAM78B	Q5VT40	261 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	OR11H2	Q8NH07	326 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	AQP10	Q96PS8	301 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	RARRES2	Q99969	163 aa		13.81	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649		H3BQ15	152 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	CXCL2	P19875	107 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	FXYD7	P58549	80 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	XCL2	Q9UBD3	114 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	RFNG	Q9Y644	331 aa		13.8	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	HRH4	Q9H3N8	390 aa		13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	C3orf84	H3BNL1	204 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	PYY	P10082	97 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	PSG3	Q16557	428 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		13.78	□□□□□ -0.2
NUBPL-208	ENST00000550649		G3V3Q6	166 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	MFF	Q9GZY8	342 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		13.77	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	RNF222	A6NCQ9	220 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	SMLR1	H3BR10	107 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	PSG9	Q00887	426 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		13.76	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	DEFB4A	O15263	64 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF266	Q14584	549 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	GUK1	Q16774	197 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	CASC10	Q5T4H9	136 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	FUT9	Q9Y231	359 aa		13.75	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649		A8MTW9	85 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	DUSP14	O95147	198 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	AMTN	Q6UX39	209 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		13.74	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	OR7C2	O60412	319 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	OR10J4	P0C629	311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649		Q8NAQ8	132 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	IL17D	Q8TAD2	202 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649		X6R8D5	127 aa		13.73	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	TENM2	Q9NT68	2774 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	PRAC2	D3DTV9	90 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649		M0R2Z0	102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	ARPC5	O15511	151 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	RAB2A	P61019	212 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	RHOB	P62745	196 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	PAXX	Q9BUH6	204 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	OR51M1	Q9H341	326 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	ZNF253	O75346	499 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	NDUFB4	O95168	129 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	PMS2P11	Q13670	270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NUBPL-208	ENST00000550649	BOLA2-SMG1P6	H3BVE0	249 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	MIF	P14174	115 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	M6PR	P20645	277 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	ATP6V0C	P27449	155 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	PDE6H	Q13956	83 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	KHDC3L	Q587J8	217 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	FAM122C	Q6P4D5	195 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	BAP18	Q8IXM2	172 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NUBPL-208	ENST00000550649	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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