RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 hDV102S1A0JD36 115 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C15orf62A8K5M9 175 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF727A8MUV8 499 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 M0R2N4 97 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RTL8CO15255 209 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 GGCTO75223 188 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CLN5O75503 358 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 HRASP01112 189 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 KRASP01116 189 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV1-51P01701 117 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RBP4P02753 201 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 STAG3L2P0CL84 134 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 STAG3L3P0CL85 134 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 CD1BP29016 333 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RPL35P42766 123 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RPL29P47914 159 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 AKR1D1P51857 326 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RAB11AP62491 216 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 AESQ08117 197 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RAB31Q13636 194 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RTL8BQ17RB0 113 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 BSXQ3C1V8 233 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 OR4S2Q8NH73 311 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 Q8WTZ3 238 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf30Q96GV9 206 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 RSG1Q9BU20 258 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM133Q9H2Q1 129 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 GNG13Q9P2W3 67 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
PTPRK-211ENST00000429595 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 GATCO43716 136 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BKO60814 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 S1PR2O95136 353 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 CXorf1O96002 111 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 MT-CO2P00403 227 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1D-33P01593 117 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV1-33P01594 117 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 IGHG4P01861 327 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BJP06899 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 IAPPP10997 89 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BOP23527 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BBP33778 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 G6PCP35575 357 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 EDDM3BP56851 147 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BDP58876 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ERVK-16P61578 105 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BCP62807 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 RPL23P62829 140 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 GNB1P62873 340 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 COX19Q49B96 90 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LCN12Q6JVE5 192 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LCN15Q6UWW0 184 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00311Q8N616 119 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF439Q8NDP4 499 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OR4A16Q8NH70 328 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OR4A5Q8NH83 315 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 MRGPRDQ8TDS7 321 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 CACNG8Q8WXS5 425 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ISOC2Q96AB3 205 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF714Q96N38 554 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 RNF2Q99496 336 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 S1PR3Q99500 378 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 SMIM7Q9BQ49 75 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 VSIRQ9H7M9 311 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 GNB4Q9HAV0 340 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 PRNDQ9UKY0 176 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 KMT2AQ03164 3969 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 A0A1W2PPE3 182 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 C15orf61A6NNL5 157 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 OOSP1A8MZH6 123 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRK-211ENST00000429595 IGLL5B9A064 214 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.6 ms