RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 FAM27E3Q08E93 113 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 C11orf44Q8N8P7 122 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 ERG28Q9UKR5 140 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 MYLKQ15746 1914 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1B0GV90 55 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 PINLYPA6NC86 204 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 RAMP3O60896 148 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 LTAP01374 205 aa5.77□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 NTF4P34130 210 aa5.77□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 LY6G5BQ8NDX9 201 aa5.77□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.76□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.75□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 SAMD5Q5TGI4 173 aa5.75□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 RIPPLY3P57055 190 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 C17orf58Q2M2W7 97 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 LCN12Q6JVE5 192 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 C10orf126Q8N4M7 172 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 FGFBP3Q8TAT2 258 aa5.75□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 C7orf69Q9H7B7 122 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 METRNQ9UJH8 293 aa5.75□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 TDGF1P3P51864 188 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM170BQ5T4T1 132 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 STHQ8IWL8 128 aa5.74□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa5.74□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PRF3 423 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 A0A1W2PRM7 423 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 PSMB11A5LHX3 300 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 GZMBP10144 247 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 C11orf1Q9H5F2 150 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 COX11Q9Y6N1 276 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 H3BMM0 161 aa5.74□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 CELA3BP08861 270 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 ADCYAP1P18509 176 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF124Q15973 351 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 RMI2Q96E14 147 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00473A8K010 186 aa5.74□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 C3orf79P0CE67 100 aa5.74□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.74□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 IGHV1-69P01742 117 aa5.73□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 DMRTC1Q5HYR2 192 aa5.73□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 SPRY4Q9C004 299 aa5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.73□□□□□ -1.49
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ALMS1-201ENST00000423048 Q9UFV3 132 aa5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 C9orf118A6NHY6 69 aa5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 ATP5G1P05496 136 aa5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 Q71RC1 249 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 SPAG17Q6Q759 2223 aa5.73□□□□□ -1.49
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF815PA8K554 130 aa5.73□□□□□ -1.49
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