RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEFB129Q9H1M3 183 aa25.47■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 BTDP43251 543 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 HTRA3P83110 453 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K12Q12852 859 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 CST9Q5W186 159 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP40Q9NVE5 1235 aa25.46■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.45■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.45■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMOD2Q9NZR1 351 aa25.45■■□□□ 1.67
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 ERC2O15083 957 aa25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE1AP54750 535 aa25.45■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP7A1P22680 504 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 RASA3Q14644 834 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAP2Q9UGK3 403 aa25.44■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNFAIP1Q13829 316 aa25.43■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH7P12883 1935 aa25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 IGSF3O75054 1194 aa25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.42■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 NFIAQ12857 509 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNTNAP1P78357 1384 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE6AP16499 860 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 TNNI2P48788 182 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 RHBDL3P58872 404 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 CREBZFQ9NS37 354 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa25.41■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCP10Q12799 353 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.4■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHGBP05060 677 aa25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.39■■□□□ 1.66
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAG3O95817 575 aa25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.651e-6■■■□□ 18.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 AK9Q5TCS8 1911 aa25.38■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDE4AP27815 886 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM83AQ86UY5 434 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEPSINQ96N21 525 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGS3P49796 1198 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP4CP60510 307 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 IDI2Q9BXS1 227 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP350Q5VT06 3117 aa25.37■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 NF2P35240 595 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADD2P35612 726 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 PICALMQ13492 652 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRKG1Q13976 671 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 TEX11Q8IYF3 940 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.36■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 MOB2Q70IA6 237 aa25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM151AQ8WW52 585 aa25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 FZD1Q9UP38 647 aa25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 SSC5DA1L4H1 1573 aa25.35■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLCG2P16885 1265 aa25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.34■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.33■■□□□ 1.65
CCNDBP1-208ENST00000566515 FOCADQ5VW36 1801 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 ENTPD3O75355 529 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE3CQ15386 1083 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 FSD1Q9BTV5 496 aa25.32■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 HUNKP57058 714 aa25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 EVI5LQ96CN4 794 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.3■■□□□ 1.64
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.2 ms