RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 BTDP43251 543 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 CACNB3P54284 484 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 USP40Q9NVE5 1235 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 CYP7A1P22680 504 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 PDE4AP27815 886 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 DOCK2Q92608 1830 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 CST9Q5W186 159 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 CDCA5Q96FF9 252 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 PDE6AP16499 860 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 APLP1P51693 650 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 RHBDL3P58872 404 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 RASA3Q14644 834 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 OSBPL3Q9H4L5 887 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 CEP350Q5VT06 3117 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 HSPA6P17066 643 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-208ENST00000566059 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 PPP4CP60510 307 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 NFIAQ12857 509 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 TNFAIP1Q13829 316 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 CNTNAP1P78357 1384 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 CHGBP05060 677 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 ADD2P35612 726 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 SLFNL1Q499Z3 407 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 BAG3O95817 575 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 TNNI2P48788 182 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 FAM83AQ86UY5 434 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 IDI2Q9BXS1 227 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 TEPSINQ96N21 525 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 HTRA3P83110 453 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 TCP10Q12799 353 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 UBE3CQ15386 1083 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 FAM151AQ8WW52 585 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 PLCG2P16885 1265 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 RGS3P49796 1198 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 TEX11Q8IYF3 940 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 CREBZFQ9NS37 354 aa21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 EVI5LQ96CN4 794 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 TRPM7Q96QT4 1865 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-208ENST00000566059 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 ENTPD3O75355 529 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 PICALMQ13492 652 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 FSD1Q9BTV5 496 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 CERS3Q8IU89 383 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 NF2P35240 595 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 SKAP1Q86WV1 359 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 MOB2Q70IA6 237 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 FZD1Q9UP38 647 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 PRKG1Q13976 671 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-208ENST00000566059 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms