RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.02■■□□□ 1.12
HERC3-205ENST00000426683 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.02■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.01■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 SSC5DA1L4H1 1573 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 LDHCP07864 332 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 BTDP43251 543 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 FAM83AQ86UY5 434 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 TEPSINQ96N21 525 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 FZD1Q9UP38 647 aa22■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.99■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.98■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 AOC2O75106 756 aa21.98■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 NFIAQ12857 509 aa21.98■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.98■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 IGSF3O75054 1194 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 IDH1O75874 414 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 TCP10Q12799 353 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 CCDC102AQ96A19 550 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 ATP5JP18859 108 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 MAP3K11Q16584 847 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 FAM151AQ8WW52 585 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 FAM198AQ9UFP1 575 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC3-205ENST00000426683 MAP2K2P36507 400 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 RHBDL3P58872 404 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 IDI2Q9BXS1 227 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.95■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 GOLIM4O00461 696 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 SLC10A3P09131 477 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 IREB2P48200 963 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 RGS3P49796 1198 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 MAP3K12Q12852 859 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 NOGQ13253 232 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 LDLRAD1Q5T700 205 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ENTPD3O75355 529 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 BAG3O95817 575 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 CYP7A1P22680 504 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 MAST2Q6P0Q8 1798 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ZFPM1Q8IX07 1006 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 GCC1Q96CN9 775 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ECHDC1Q9NTX5 307 aa21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 PICALMQ13492 652 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 HOOK2Q96ED9 719 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 GPATCH3Q96I76 525 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ZIC5Q96T25 663 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 HAUS7Q99871 368 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 PPP4CP60510 307 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 TEX11Q8IYF3 940 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 WBP1LQ9NX94 342 aa21.9■■□□□ 1.1
HERC3-205ENST00000426683 UNCXA6NJT0 531 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 PLCG2P16885 1265 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 DCAF15Q66K64 600 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 AIDAQ96BJ3 306 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC3-205ENST00000426683 IGHDP01880 384 aa21.88■■□□□ 1.09
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