RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371953.7

PTEN-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTEN, Length 9,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-201ENST00000371953 TCERG1LQ5VWI1 586 aa18.52■□□□□ 0.56
PTEN-201ENST00000371953 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.52■□□□□ 0.56
PTEN-201ENST00000371953 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.52■□□□□ 0.56
PTEN-201ENST00000371953 SATB2Q9UPW6 733 aa18.52■□□□□ 0.56
PTEN-201ENST00000371953 NSD2O96028 1365 aa18.52■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TMTC1Q8IUR5 882 aa18.52■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 STK38LQ9Y2H1 464 aa18.52■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 IL16Q14005 1332 aa18.52■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.52■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PPP2R5EQ16537 467 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 CCDC25Q86WR0 208 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 DTNBP1Q96EV8 351 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SDSP20132 328 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TERF2Q15554 542 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ARMC2Q8NEN0 867 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 HLA-DOAP06340 250 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 GNGT1P63211 74 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 NOX5Q96PH1 765 aa18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ST5P78524 1137 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 HVCN1Q96D96 273 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 NAIPQ13075 1403 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 FRMD3A2A2Y4 597 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 CCHCR1Q8TD31 782 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 IQCDQ96DY2 449 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 IGSF22Q8N9C0 903 aa18.5■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 HOMER3Q9NSC5 361 aa18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PARP2Q9UGN5 583 aa18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TXNDC9O14530 226 aa18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 USP6NLQ92738 828 aa18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 YY1AP1Q9H869 796 aa18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SEL1L2Q5TEA6 688 aa18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SAMM50Q9Y512 469 aa18.49■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TTC36A6NLP5 189 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 E2F4Q16254 413 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 RAB17Q9H0T7 212 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PPP1R2P41236 205 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 GSTO1P78417 241 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 UBL4BQ8N7F7 174 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PSMD7P51665 324 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TMEM67Q5HYA8 995 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ARHGAP45Q92619 1136 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 KAT14Q9H8E8 782 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 COMMD10Q9Y6G5 202 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TADA2BQ86TJ2 420 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 MYO1CO00159 1063 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 FAM204AQ9H8W3 233 aa18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.48■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 BICD1Q96G01 975 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PDE11AQ9HCR9 933 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SKIP12755 728 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 VWA3BQ502W6 1294 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 NUP58Q9BVL2 599 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 CCT5P48643 541 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ABCC5O15440 1437 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 DRC3Q9H069 523 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 BIRC2Q13490 618 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 USP16Q9Y5T5 823 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SCINQ9Y6U3 715 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PRXQ9BXM0 1461 aa18.47■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa18.46■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa18.46■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 TMED1Q13445 227 aa18.46■□□□□ 0.55
PTEN-201ENST00000371953 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 170.7 ms