RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301730.12

RNPS1-201, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RNPS1, Length 1,276 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-201ENST00000301730 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa25.25■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 TEPSINQ96N21 525 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa25.24■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 DOCK2Q92608 1830 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 GSTO1P78417 241 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 RGMBQ6NW40 437 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 FAM83AQ86UY5 434 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 CDAN1Q8IWY9 1227 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 TMEM39BQ9GZU3 492 aa25.23■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 BTDP43251 543 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 GRM1Q13255 1194 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 USP40Q9NVE5 1235 aa25.22■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 RFX7Q2KHR2 1363 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 IGSF3O75054 1194 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 LDHCP07864 332 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 PRKG1Q13976 671 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 FZD1Q9UP38 647 aa25.21■■□□□ 1.63
RNPS1-201ENST00000301730 NFIAQ12857 509 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.2■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 MAP3K11Q16584 847 aa25.19■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 FAM198AQ9UFP1 575 aa25.19■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 AOC2O75106 756 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 ATP5JP18859 108 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 RHBDL3P58872 404 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 FAM151AQ8WW52 585 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 IDI2Q9BXS1 227 aa25.18■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 CCDC102AQ96A19 550 aa25.17■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 OTOFQ9HC10 1997 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 SLC10A3P09131 477 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 MAP2K2P36507 400 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 TCP10Q12799 353 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 NOGQ13253 232 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 ADGRA1Q86SQ6 560 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 RGS3P49796 1198 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 GCC1Q96CN9 775 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.15■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 ENTPD3O75355 529 aa25.14■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 MAP3K12Q12852 859 aa25.14■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.14■■□□□ 1.62
RNPS1-201ENST00000301730 AK9Q5TCS8 1911 aa25.14■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 GOLIM4O00461 696 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 ZIC5Q96T25 663 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 HAUS7Q99871 368 aa25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 CYP7A1P22680 504 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 PPP4CP60510 307 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 HOOK2Q96ED9 719 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 WBP1LQ9NX94 342 aa25.12■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 UNCXA6NJT0 531 aa25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 BAG3O95817 575 aa25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 PICALMQ13492 652 aa25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 GPATCH3Q96I76 525 aa25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.11■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 TEX11Q8IYF3 940 aa25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 FOCADQ5VW36 1801 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 PLCG2P16885 1265 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.09■■□□□ 1.61
RNPS1-201ENST00000301730 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms