RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	DIRAS1	O95057	198 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	GADD45G	O95257	159 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB3A	P20336	220 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SMIM11A	P58511	58 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	CTAG1A	P78358	180 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SSX1	Q16384	188 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	DAND5	Q8N907	189 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	RFK	Q969G6	155 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	UPK2	O00526	184 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	HPRT1	P00492	218 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	TCL1A	P56279	114 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	FOXI1	Q12951	378 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	HAO1	Q9UJM8	370 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC2A5	P22732	501 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SERPINB10	P48595	397 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	MEOX2	P50222	304 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SRPX	P78539	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T29	Q8NH02	315 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WX48	190 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	ZAR1L	A6NP61	321 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	LALBA	P00709	142 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	IL4	P05112	153 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	SYS1	Q8N2H4	156 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10G4	Q8NGN3	311 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440		Q8WTZ3	238 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM56	Q96MV1	263 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	PECR	Q9BY49	303 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL15	A6NJ78	407 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	BET1	O15155	118 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	PTTG1IP	P53801	180 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	ST3GAL4	Q11206	333 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF876P	Q49A33	203 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	GLYAT	Q6IB77	296 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF738	Q8NE65	137 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	MUL1	Q969V5	352 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	SH3GL1	Q99961	368 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	SHANK2-AS3	Q9BTD1	123 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	BANF2	Q9H503	90 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440		E9PI62	339 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440		J3KRW8	73 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1-17	P01599	117 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	PTHLH	P12272	177 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	AMT	P48728	403 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	BTN1A1	Q13410	526 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	GAGE13	Q4V321	117 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC21	Q5SSG8	566 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	ENHO	Q6UWT2	76 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC190	Q86UF4	302 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX12	Q9BXU0	123 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	CLN6	Q9NWW5	311 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WZ39	114 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC182	A6NF36	153 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440		F5H697	171 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	CD3G	P09693	182 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	CD37	P11049	281 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SNAP23-223	ENST00000627440	HRH1	P35367	487 aa		3.3	□□□□□ -1.88

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