RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.78□□□□□ -1
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.76□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 PRSS29PA6NIE9 313 aa8.74□□□□□ -1.01
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CAPNS1-209ENST00000590049 HAGHQ16775 308 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 TMED6Q8WW62 240 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 CHRDL1Q9BU40 450 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 C19orf73Q9NVV2 129 aa8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.74□□□□□ -1.01
CAPNS1-209ENST00000590049 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.74□□□□□ -1.01
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