RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587769.1

CTIF-204, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-204ENST00000587769 PRR20DP86480 221 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 PRR20BP86481 221 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 PRR20AP86496 221 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 RSG1Q9BU20 258 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 DOK5Q9P104 306 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 COX7A2P2O60397 106 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 HYPMO75409 117 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 JTBO76095 146 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 ORM2P19652 201 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 NPPCP23582 126 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 CRYBB3P26998 211 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 S100A7P31151 101 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 INSL3P51460 131 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 Q6ZRG5 221 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 TMUB2Q71RG4 321 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 SMPXQ9UHP9 88 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 PFDN2Q9UHV9 154 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.22□□□□□ -1.09
CTIF-204ENST00000587769 A0A1W2PS18 150 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 CHEK1O14757 476 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 OR5G3P0C626 314 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ATP6V0CP27449 155 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 S100A7AQ86SG5 101 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 OR1L4Q8NGR5 311 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ST8SIA2Q92186 375 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 PFDN5Q99471 154 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ARV1Q9H2C2 271 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 VSIRQ9H7M9 311 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 MLXQ9UH92 298 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 U3KQE9 123 aa8.21□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 H3BRN7 92 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 IGLV1-51P01701 117 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 C4BPBP20851 252 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 UHRF2Q96PU4 802 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.2□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 BUB3O43684 328 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 LCN12Q6JVE5 192 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 PATE2Q6UY27 113 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 STOML3Q8TAV4 291 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 RNF2Q99496 336 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SCRT1Q9BWW7 348 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.19□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 HELTA6NFD8 242 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ZNF98A6NK75 572 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 CD5P06127 495 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 TCF24Q7RTU0 167 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 GLMPQ8WWB7 406 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 SLC25A22Q9H936 323 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.18□□□□□ -1.1
CTIF-204ENST00000587769 RNF24Q9Y225 148 aa8.18□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms