RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486829.1

ARHGEF3-211, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 3

Gene ARHGEF3, Length 428 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.71□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 PXMP4Q9Y6I8 212 aa8.71□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SEC14L6B5MCN3 397 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 WIPF1O43516 503 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 HYPMO75409 117 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SAP30O75446 220 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 FOLR2P14207 255 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 CBLN1P23435 193 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 CRYBB3P26998 211 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 TM4SF20Q53R12 229 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9orf66Q5T8R8 295 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 MIC13Q5XKP0 118 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 IL34Q6ZMJ4 242 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 HIGD1AQ9Y241 93 aa8.7□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 COX7A2P2O60397 106 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 CSN3P07498 182 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ORM2P19652 201 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SERF2P84101 59 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEFA6Q01524 100 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 STOML3Q8TAV4 291 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 RNF2Q99496 336 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 RSG1Q9BU20 258 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ARV1Q9H2C2 271 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SMPXQ9UHP9 88 aa8.69□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 MBP02144 154 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR5G3P0C626 314 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ATP6V0CP27449 155 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC51BQ86UW2 128 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 VSIRQ9H7M9 311 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 U3KQE9 123 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.68□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 HELTA6NFD8 242 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 CHEK1O14757 476 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 BUB3O43684 328 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 FFAR4Q5NUL3 377 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 BAP18Q8IXM2 172 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 GPR82Q96P67 336 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 DOK5Q9P104 306 aa8.67□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 H3BRN7 92 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLV1-51P01701 117 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SEC11BP0C7V7 166 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SPP1P10451 314 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGLL1P15814 213 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 M6PRP20645 277 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 LINC00305Q7Z4B0 112 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 TMEM37Q8WXS4 190 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ST8SIA2Q92186 375 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 MLXQ9UH92 298 aa8.66□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 ZNF98A6NK75 572 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 G3V4G9 280 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 RHOBP62745 196 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 LCN12Q6JVE5 192 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 PATE2Q6UY27 113 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 GLMPQ8WWB7 406 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 UHRF2Q96PU4 802 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 SH3BGRL3Q9H299 93 aa8.65□□□□□ -1.02
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.64□□□□□ -1.03
ARHGEF3-211ENST00000486829 UMAD1C9J7I0 102 aa8.64□□□□□ -1.03
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