RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 TAS2R19P59542 299 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 DEFB1P60022 68 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 TMEM229BQ8NBD8 167 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 OR51G1Q8NGK1 321 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 GLYATL2Q8WU03 294 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 TMEM170AQ8WVE7 144 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 LINC00052Q96N35 136 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 RFNGQ9Y644 331 aa12.13□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 CD74P04233 296 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 PSG1P11464 419 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 MEF2DQ14814 521 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 TMEM268Q5VZI3 342 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 STEAP1BQ6NZ63 245 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 NOXA1Q86UR1 476 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 FAM210BQ96KR6 192 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 ABHD1Q96SE0 405 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 PBDC1Q9BVG4 233 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 NAA60Q9H7X0 242 aa12.12□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 HTN3P15516 51 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 ID1P41134 155 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 SOHLH1Q5JUK2 328 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 FAM222AQ5U5X8 452 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 AP3S1Q92572 193 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 RNF125Q96EQ8 232 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 DKK2Q9UBU2 259 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 PFDN2Q9UHV9 154 aa12.11□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 FAAP20Q6NZ36 180 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 Q6ZR54 194 aa12.1□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 NMSQ5H8A3 153 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 FOXI2Q6ZQN5 318 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 ZNF575Q86XF7 245 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 COQ8AQ8NI60 647 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 C15orf40Q8WUR7 153 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 SLC35B3Q9H1N7 401 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa12.09□□□□□ -0.47
CS-214ENST00000548849 DISC1C4P0D8 188 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SULT1A3P0DMM9 295 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SULT1A4P0DMN0 295 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 RNF212Q495C1 297 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 GPR107Q5VW38 600 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 GSG1LQ6UXU4 331 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 CACFD1Q9UGQ2 172 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 U3KQ87 197 aa12.08□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 ZFP92A6NM28 416 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 HBE1P02100 147 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 PSMB3P49720 205 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 PSG9Q00887 426 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 C1orf134Q5TEV5 83 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 OR8G2PQ6IF36 304 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 LGI3Q8N145 548 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 ZNF709Q8N972 641 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 CLUHP3Q96NS8 147 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 GPR132Q9UNW8 380 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 F6UB75 175 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 GABARAPH6UMI1 98 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 GABARAPO95166 117 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 LYZP61626 148 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 ZNF90Q03938 601 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 OXA1LQ15070 435 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 EBLN2Q6P2I7 272 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 TMEM88Q6PEY1 159 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 DTD1Q8TEA8 209 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 PPP1R14BQ96C90 147 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 PRR13Q9NZ81 148 aa12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SOCS3O14543 225 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 DAD1P61803 113 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 ZNF79Q15937 498 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 RRN3P1Q2M238 152 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 FAM78BQ5VT40 261 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SLC35E1Q96K37 410 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 RBKSQ9H477 322 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa12.05□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 SNRPGP15A8MWD9 76 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 AKAIN1P0CW23 69 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 GAMTQ14353 236 aa12.04□□□□□ -0.48
CS-214ENST00000548849 C1orf194Q5T5A4 169 aa12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms