RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460120.5

HPS3-202, Transcript of HPS3, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HPS3, Length 2,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3-202ENST00000460120 SIGLEC9Q9Y336 463 aa14.52□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 KIR3DL3Q8N743 410 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 VKORC1Q9BQB6 163 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CLEC7AQ9BXN2 247 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 PMCHP20382 165 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 LGALS7P47929 136 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 PRRX1P54821 245 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 LYZP61626 148 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ARF6P62330 175 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CX3CL1P78423 397 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 RCHY1Q96PM5 261 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ASCL2Q99929 193 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 OSTCQ9NRP0 149 aa14.51□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 SRIP30626 198 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 DNLZQ5SXM8 178 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF596Q8TC21 504 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CNIH1O95406 144 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TPPP2P59282 170 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 UBE2G1P62253 170 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 KLRD1Q13241 179 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CHODLQ9H9P2 273 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 RBP4P02753 201 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 G0S2P27469 103 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF137PP52743 207 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 RNF114Q9Y508 228 aa14.5□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 FSTL3O95633 263 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 IGLV1-47P01700 117 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CAMPP49913 170 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 SELENOTP62341 195 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 THAP8Q8NA92 274 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 C22orf15Q8WYQ4 148 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 RNF2Q99496 336 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 MED13LQ71F56 2210 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 COMPP49747 757 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 KRTDAPP60985 99 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 PERPQ96FX8 193 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 RAXQ9Y2V3 346 aa14.49□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF253O75346 499 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 NUDT10Q8NFP7 164 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 NUDT11Q96G61 164 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TIMM23O14925 209 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 MMDQ15546 238 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 FAM19A2Q8N3H0 131 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TEX45Q8NA69 505 aa14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 HYPMO75409 117 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 NBEAP1P0C6P0 100 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 PAM16Q9Y3D7 125 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 EREGO14944 169 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 AMY1AP04745 511 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 SLAQ13239 276 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 C2orf88Q9BSF0 95 aa14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TEX22C9J3V5 150 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 BMPR1BO00238 502 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 PAX1P15863 534 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 NTF3P20783 257 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 HES1Q14469 280 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 FBLN7Q53RD9 439 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 ATG101Q9BSB4 218 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 PSG1P11464 419 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 TCF24Q7RTU0 167 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 EPDR1Q9UM22 224 aa14.46□□□□□ -0.09
HPS3-202ENST00000460120 APCSP02743 223 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 AMTP48728 403 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 OR8B3Q8NGG8 313 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 OR8B2Q96RD0 313 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 NDUFAF3Q9BU61 184 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
HPS3-202ENST00000460120 CRYGBP07316 175 aa14.44□□□□□ -0.1
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