RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 C15orf62A8K5M9 175 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MWP6 167 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SSSCA1O60232 199 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IL5P05113 134 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC25A4P12235 298 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFA1P59665 94 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFA3P59666 94 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 RPP30P78346 268 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 CD69Q07108 199 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 BTNL8Q6UX41 500 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF600Q6ZNG1 722 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8N1Y9 231 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 OR4D5Q8NGN0 318 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 MARC2Q969Z3 335 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 ASCL2Q99929 193 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SMPXQ9UHP9 88 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.13□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 NOTCH1P46531 2555 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SORL1Q92673 2214 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 H3BP45 60 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV1-17P01599 117 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 MBPP02686 304 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 CD7P09564 240 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 NPPCP23582 126 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 OR10J1P30954 320 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 PAX9P55771 341 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 CD81P60033 236 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 GAMTQ14353 236 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC16A13Q7RTY0 426 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 OR1S2Q8NGQ3 325 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8WTZ3 238 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC35E1Q96K37 410 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM8Q96KF7 97 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 C2orf50Q96LR7 162 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 NEURL2Q9BR09 285 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 TUBA4BQ9H853 241 aa5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFP92A6NM28 416 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 L7N2F9 121 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 CHEK1O14757 476 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SCGB2A1O75556 95 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 CCNKO75909 580 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SIX6O95475 246 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLC1P0CG04 106 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 RD3LP0DJH9 198 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 TFPI2P48307 235 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 VAMP2P63027 116 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 OR8G2PQ6IF36 304 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 WFDC3Q8IUB2 231 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 LILRB2Q8N423 598 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 DEFB125Q8N687 156 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 ST8SIA2Q92186 375 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 RNF2Q99496 336 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 B9D2Q9BPU9 175 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 GINS3Q9BRX5 216 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 ZFAND3Q9H8U3 227 aa5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SMCO3A2RU48 225 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 C7orf66A4D0T2 115 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 OR11H12B2RN74 326 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 GOSR2O14653 212 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 PRAF2O60831 178 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 DFFBO76075 338 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 TOMM40O96008 361 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 IL4P05112 153 aa5.1□□□□□ -1.59
EFTUD2-211ENST00000588374 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms