RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 OR5G3P0C626 314 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CRISP2P16562 243 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 BCL3P20749 454 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TSPOP30536 169 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CEBPGP53567 150 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ARF6P62330 175 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 LRRC10Q5BKY1 277 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 FAM78BQ5VT40 261 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ANKRD37Q7Z713 158 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 NIT1Q86X76 327 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF738Q8NE65 137 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OR10G9Q8NGN4 311 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SGMS2Q8NHU3 365 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ITLN1Q8WWA0 313 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 RDH5Q92781 318 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 NPCDR1Q9BY65 106 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 SH2D2AQ9NP31 389 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 OSTCQ9NRP0 149 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.84□□□□□ -1.79
TRDN-204ENST00000542443 CEP192Q8TEP8 1941 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 MYO7AQ13402 2215 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 TTC28Q96AY4 2481 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 BDP1A6H8Y1 2624 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 CD300LBA8K4G0 201 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 C11orf94C9JXX5 98 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 NDUFS8O00217 210 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR2J3O76001 311 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 S1PR2O95136 353 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 SERPINE2P07093 398 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 PSG2P11465 335 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OPRK1P41145 380 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 GFERP55789 205 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 DSCR10P59022 87 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 RPL19P84098 196 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 PSG4Q00888 419 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 MMDQ15546 238 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 MAJINQ3KP22 176 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 CEACAM21Q3KPI0 293 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 LINC00242Q5T6M2 205 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 SLC25A24Q6NUK1 477 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 TMEM136Q6ZRR5 245 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 NECAP1Q8NC96 275 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR5A2Q8NGI9 324 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 DNAJA3Q96EY1 480 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 KCNS1Q96KK3 526 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 DEFB118Q96PH6 123 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 HSPB9Q9BQS6 159 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 PKIBQ9C010 78 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 SLC35D1Q9NTN3 355 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 V9GYV3 84 aa3.83□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 RTTNQ86VV8 2226 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 A0A1B0GUS0 222 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR5B21A6NL26 309 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 LRRC30A6NM36 301 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 ZNF716A6NP11 495 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 HLA-DQA1P01909 254 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 NBEAP1P0C6P0 100 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 LINC00869P0C866 280 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 GABRG2P18507 467 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 TUBG1P23258 451 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 PCBD1P61457 104 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 PSG7Q13046 419 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 SPATA45Q537H7 98 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 Q6P435 159 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 SMIM15Q7Z3B0 74 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 LRP11Q86VZ4 500 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 MKXQ8IYA7 352 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR10G3Q8NGC4 313 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR8B3Q8NGG8 313 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR52E5Q8NH55 327 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 PSMF1Q92530 271 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 CLDN23Q96B33 292 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 STARD4Q96DR4 205 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR8B2Q96RD0 313 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 TXN2Q99757 166 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 LINC00470Q9BZP3 86 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 PRO3102Q9H379 93 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa3.82□□□□□ -1.8
TRDN-204ENST00000542443 SLC25A22Q9H936 323 aa3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms