RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521038.5

PHF20L1-217, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, human

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 427 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PHF20L1-217	ENST00000521038		K7EMI3	77 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	RHOD	O00212	210 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPINT2	O43291	252 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	FCN3	O75636	299 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SNCG	O76070	127 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SP1	P08047	785 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGFBP2	P18065	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	EGR1	P18146	543 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARL4D	P49703	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLP2	Q04941	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038		Q6ZPA2	131 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	MOB3B	Q86TA1	216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PDPN	Q86YL7	162 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SHISA5	Q8N114	240 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	FOXB1	Q99853	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	IMUP	Q9GZP8	106 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SLC31A1	O15431	190 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	NDUFS7	O75251	213 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CER1	O95813	267 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	IL4	P05112	153 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF688	P0C7X2	276 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	IFITM1	P13164	125 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF32	P17041	273 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLN	P26678	52 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	MLF1	P58340	268 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	FXYD3	Q14802	87 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLGLA	Q15195	96 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	C2orf83	Q53S99	150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PPP1R32	Q7Z5V6	425 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PIP4P1	Q86T03	277 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	YAF2	Q8IY57	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038		Q8TCH9	128 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CYYR1	Q96J86	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ARID1A	O14497	2285 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038		A0A1W2PPI3	338 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	IGLL5	B9A064	214 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038		E9PLN8	166 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PRRG2	O14669	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	MGST3	O14880	152 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CELA2A	P08217	269 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CELA3A	P09093	270 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	NTF4	P34130	210 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	UQCRFS1	P47985	274 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CAMP	P49913	170 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CCL11	P51671	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	ORMDL3	Q8N138	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PHF20L1-217	ENST00000521038	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.78	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.9 ms