RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 NPY1RP25929 384 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM200BQ69YZ2 307 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM256Q8N2U0 113 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM106BQ9NUM4 274 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR51B2Q9Y5P1 312 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 J3QR06 171 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SAP30O75446 220 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 HRASP01112 189 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 GATA3P23771 443 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 KIR2DS2P43631 304 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MLANAQ16655 118 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 Q8N7P7 452 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ZNF714Q96N38 554 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 MGST2Q99735 147 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PARLQ9H300 379 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 LINC00312Q9Y6C7 94 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PXMP4Q9Y6I8 212 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM89A2RUT3 159 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NDUFB3O43676 98 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ACTL6BO94805 426 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 GALR1P47211 349 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 RTL8BQ17RB0 113 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NGBQ9NPG2 151 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CTSZQ9UBR2 303 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CHD6Q8TD26 2715 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C11orf94C9JXX5 98 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CORTO00230 105 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-48P01763 117 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ATP5G3P48201 142 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TPPP2P59282 170 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 VWC2Q2TAL6 325 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM86BQ8N661 226 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 GGTLC1Q9BX51 225 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 GAGE12BA1L429 117 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ARL14EPLP0DKL9 152 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PRSS8Q16651 343 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C10orf55Q5SWW7 151 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 OR52E5Q8NH55 327 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 HARBI1Q96MB7 349 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 P2RX4Q99571 388 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 DERL1Q9BUN8 251 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PGPEP1LA6NFU8 196 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 LY6HO94772 140 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TOMM40O96008 361 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CDKN1AP38936 164 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CEACAM3P40198 252 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 C16orf82Q7Z2V1 217 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 PRSS46E5RG02 174 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 KBTBD11O94819 623 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CD3EP07766 207 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 APELAP0DMC3 54 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NPPCP23582 126 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 CRYBA4P53673 196 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 ARF6P62330 175 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 BSXQ3C1V8 233 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NAT8Q9UHE5 227 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 DIRC3C9JPN6 131 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 UPK2O00526 184 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 NDUFB4O95168 129 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 APOA2P02652 100 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 RAB9AP51151 201 aa5.66□□□□□ -1.5
HERC4-211ENST00000492996 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
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