RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM140Q9NV12 185 aa11.78□□□□□ -0.52
SPCS1-201ENST00000233025 HPRT1P00492 218 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ANXA3P12429 323 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 DEFA4P12838 97 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CD300CQ08708 224 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 FCN2Q15485 313 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TCTE3Q8IZS6 198 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 OR10W1Q8NGF6 305 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 AIFM2Q9BRQ8 373 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 COMMD9Q9P000 198 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 X6R8D5 127 aa11.77□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 GNRHRP30968 328 aa11.76□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RNF212Q495C1 297 aa11.76□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA12Q7Z6I5 190 aa11.76□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 OR13C8Q8NGS7 320 aa11.76□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 OR4E1P0C645 316 aa11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PGAM2P15259 253 aa11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RPA2P15927 270 aa11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 WT1-ASQ06250 92 aa11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MGAT4CQ9UBM8 478 aa11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 DMBX1Q8NFW5 382 aa11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZFAND1Q8TCF1 268 aa11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MARCH1Q8TCQ1 289 aa11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MOB3AQ96BX8 217 aa11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 FXYD6Q9H0Q3 95 aa11.74□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 MARCH11A6NNE9 402 aa11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 F8W735 103 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TGOLN2O43493 480 aa11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 HERV-K104P61576 105 aa11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 NOXA1Q86UR1 476 aa11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 GPR132Q9UNW8 380 aa11.73□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 C1QBP02746 253 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 SERPINE2P07093 398 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 OR13C7P0DN81 318 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 AKR1C4P17516 323 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 F2RP25116 425 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 Q5VSD8 79 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 LHFPL1Q86WI0 220 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 C6orf223Q8N319 242 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 OR11H7Q8NGC8 314 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 ASB13Q8WXK3 278 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 RNF2Q99496 336 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 THYN1Q9P016 225 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 K7EIM0 57 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 VAMP1P23763 118 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TFPI2P48307 235 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 OR1L8Q8NGR8 309 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 NSG2Q9Y328 171 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 OR2T8A6NH00 312 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 DBX1A6NMT0 343 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP10-2P60368 255 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 RAP2BP61225 183 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-16P61578 105 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 DHRS2Q13268 280 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 HYLS1Q96M11 299 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ATP6V0BQ99437 205 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 C9orf170A2RU37 121 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 GOSR2O14653 212 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 KRASP01116 189 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 CXCL3P19876 107 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 C4BPBP20851 252 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 G6PCP35575 357 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 LPAR6P43657 344 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 PPP1R1AQ13522 171 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM41BQ5BJD5 291 aa11.69□□□□□ -0.54
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