RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-231	ENST00000640501	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	LCN2	P80188	198 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	EBI3	Q14213	229 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	FXYD3	Q14802	87 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	C5orf64	Q2M2E5	130 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	OR4X1	Q8NH49	305 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	CFHR4	Q92496	578 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	ISOC2	Q96AB3	205 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	TMEM68	Q96MH6	324 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	IMMP2L	Q96T52	175 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	SIRPD	Q9H106	197 aa		6.66	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	TEX22	C9J3V5	150 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	C19orf84	I3L1E1	186 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	HYPM	O75409	117 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFB4	O95168	129 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	REG1A	P05451	166 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	CTRB1	P17538	263 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	ELOB	Q15370	118 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	HCP5	Q6MZN7	132 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	OR51G1	Q8NGK1	321 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	ARPC1A	Q92747	370 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	C11orf52	Q96A22	123 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	C1orf159	Q96HA4	380 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	RITA1	Q96K30	269 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	PAXX	Q9BUH6	204 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
PNKP-231	ENST00000640501	ATRX	P46100	2492 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501		A0A1W2PPR1	153 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	HELT	A6NFD8	242 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	PPP5D1	E7EU14	171 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501		E7EUB6	86 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	IGHV4-39	P01824	125 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	COX6B1	P14854	86 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	GATA3	P23771	443 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	CNTFR	P26992	372 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	GALR1	P47211	349 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	ATP5G3	P48201	142 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	GNG4	P50150	75 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	ATP5J2	P56134	94 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	PLP1	P60201	277 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	LMO4	P61968	165 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	KLRD1	Q13241	179 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	TIGIT	Q495A1	244 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	FAM210B	Q96KR6	192 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	OR51M1	Q9H341	326 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		6.64	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	NPFF	O15130	113 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	NDUFS7	O75251	213 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	HLA-DRB1	P01911	266 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	SLC25A16	P16260	332 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	ORM2	P19652	201 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	MFAP4	P55083	255 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	LINC01551	Q86U37	167 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501		Q8WTZ3	238 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	TXN2	Q99757	166 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	BSN	Q9UPA5	3926 aa		6.63	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	PSMB11	A5LHX3	300 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	GNG7	O60262	68 aa		6.62	□□□□□ -1.35
PNKP-231	ENST00000640501	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	6.62	□□□□□ -1.35

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