RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TMEM68Q96MH6 324 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 NPCDR1Q9BY65 106 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 PRDM13Q9H4Q3 707 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 CNIH1O95406 144 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 FGF7P21781 194 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 PAX6P26367 422 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 RPL29P47914 159 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 RAB31Q13636 194 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 Q6ZRG5 221 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 C16orf82Q7Z2V1 217 aa9.41□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.41□□□□□ -0.9
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GGA3-217ENST00000583667 A6NDX4 124 aa9.4□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
GGA3-217ENST00000583667 PRH1P02810 166 aa9.4□□□□□ -0.9
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GGA3-217ENST00000583667 TEX46H3BTG2 121 aa9.39□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 M0QZ24 198 aa9.39□□□□□ -0.91
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GGA3-217ENST00000583667 HBE1P02100 147 aa9.39□□□□□ -0.91
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GGA3-217ENST00000583667 H2AFB1P0C5Y9 115 aa9.39□□□□□ -0.91
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GGA3-217ENST00000583667 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
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GGA3-217ENST00000583667 SSX3Q99909 188 aa9.39□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 GGTLC1Q9BX51 225 aa9.39□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 SMDT1Q9H4I9 107 aa9.39□□□□□ -0.91
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GGA3-217ENST00000583667 FHITP49789 147 aa9.38□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.38□□□□□ -0.91
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GGA3-217ENST00000583667 LINC00869P0C866 280 aa9.37□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 RAB2AP61019 212 aa9.37□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 SELENOTP62341 195 aa9.37□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 FFAR4Q5NUL3 377 aa9.37□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa9.37□□□□□ -0.91
GGA3-217ENST00000583667 CITED4Q96RK1 184 aa9.37□□□□□ -0.91
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