RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 CTF1Q16619 201 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 FAM219AQ8IW50 185 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 METTL26Q96S19 204 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 ABHD1Q96SE0 405 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 VSIRQ9H7M9 311 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 RABAC1Q9UI14 185 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 TRAV2A0A0B4J234 112 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 DISC1C4P0D8 188 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 GABARAPH6UMI1 98 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 CLN5O75503 358 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 P0C879 139 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 UCP1P25874 307 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 DEFB131AP59861 70 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 OR4D10Q8NGI6 311 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 OR11H2Q8NH07 326 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 ZNF414Q96IQ9 312 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 ZFAND3Q9H8U3 227 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-212ENST00000484841 CA1P00915 261 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 APOHP02749 345 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 CD74P04233 296 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 SPCS3P61009 180 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 LEMD1Q68G75 181 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 STHQ8IWL8 128 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 GRAMD2BQ96HH9 432 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 MFFQ9GZY8 342 aa14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GU03 582 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 IFNA4P05014 189 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 HTR2BP41595 481 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 DHODHQ02127 395 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 TMEM187Q14656 261 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 GPR141Q7Z602 305 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 OR4X1Q8NH49 305 aa14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 OR5AC1P0C628 307 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 PVRIGQ6DKI7 326 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 STXBP6Q8NFX7 210 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 C11orf45Q8TAV5 145 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 TMEM222Q9H0R3 208 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 NAA60Q9H7X0 242 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 FBXL17Q9UF56 701 aa14.81□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 CEBPZOSA8MTT3 80 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 CDS2O95674 445 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 SMIM18P0DKX4 95 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 OR52E5Q8NH55 327 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 CACFD1Q9UGQ2 172 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.8□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 AKAIN1P0CW23 69 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 P2RY1P47900 373 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 IL18Q14116 193 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 MLANAQ16655 118 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 FAAP20Q6NZ36 180 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 LILRB2Q8N423 598 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 Q8WTZ3 238 aa14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 A0A0G2JRQ6 117 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 TIGITQ495A1 244 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 NOXA1Q86UR1 476 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 OR1S2Q8NGQ3 325 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 PRRT1Q99946 306 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 MIXL1Q9H2W2 232 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 CACNG5Q9UF02 275 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa14.78□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 HYDINQ4G0P3 5121 aa14.77□□□□□ -0.04
ACTB-212ENST00000484841 CTDSP2O14595 271 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A4P12235 298 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 CRYBB3P26998 211 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 TMEM41BQ5BJD5 291 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZRM9 215 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 CENPSQ8N2Z9 138 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SLC24A4Q8NFF2 622 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 DNAH1Q9P2D7 4330 aa14.77□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 HELTA6NFD8 242 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 BSXQ3C1V8 233 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-212ENST00000484841 C2orf83Q53S99 150 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 193.2 ms