RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460558.5

ECHDC1-211, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ECHDC1, Length 301 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-211ENST00000460558 GPX5O75715 221 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 SULT1C4O75897 302 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 IGLV2-8P01709 118 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 ISG15P05161 165 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 CRYGCP07315 174 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB130BP0DP73 79 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 DEFB130AP0DP74 79 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 SLC2A5P22732 501 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 RRM2P31350 389 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 CDKN1BP46527 198 aa2.66□□□□□ -1.98
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ECHDC1-211ENST00000460558 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa2.66□□□□□ -1.98
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZFP69Q49AA0 526 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 C10orf55Q5SWW7 151 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 TMEM244Q5VVB8 128 aa2.66□□□□□ -1.98
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ECHDC1-211ENST00000460558 C19orf35Q6ZS72 473 aa2.66□□□□□ -1.98
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ECHDC1-211ENST00000460558 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa2.66□□□□□ -1.98
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ECHDC1-211ENST00000460558 IL1F10Q8WWZ1 152 aa2.66□□□□□ -1.98
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ECHDC1-211ENST00000460558 C4orf36Q96KX1 117 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 GPER1Q99527 375 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 EBF4Q9BQW3 602 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 AGMATQ9BSE5 352 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 GHRLQ9UBU3 117 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 AP3M1Q9Y2T2 418 aa2.66□□□□□ -1.98
ECHDC1-211ENST00000460558 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa2.65□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa2.65□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa2.65□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa2.65□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa2.65□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 LYRM9A8MSI8 78 aa2.65□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 MRASO14807 208 aa2.65□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.995e-10■■■■□ 20.2
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ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF85Q03923 595 aa2.65□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 OR1B1Q8NGR6 318 aa2.65□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 REEP1Q9H902 201 aa2.65□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF446Q9NWS9 450 aa2.65□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 KLK9Q9UKQ9 250 aa2.65□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.65□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 PANO1I0J062 215 aa2.64□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 SOCS3O14543 225 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 CYB5BO43169 146 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 SC5DO75845 299 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 CCNB2O95067 398 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 YIF1AO95070 293 aa2.64□□□□□ -1.99
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ECHDC1-211ENST00000460558 HMGN1P05114 100 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 GTF2F2P13984 249 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 SERPINA2P20848 420 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 UCP1P25874 307 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 PSMD7P51665 324 aa2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
ECHDC1-211ENST00000460558 SRPXP78539 464 aa2.64□□□□□ -1.99
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