RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 PMS2P5A8MQ11 134 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 HBE1P02100 147 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 CT45A1Q5HYN5 189 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TCF23Q7RTU1 214 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 CT45A3Q8NHU0 189 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 PYGO2Q9BRQ0 406 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 GCM1Q9NP62 436 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 C15orf62A8K5M9 175 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 P0C879 139 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 LOXL3P58215 753 aa12.38□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 OR4A16Q8NH70 328 aa12.38□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.38□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 IGHV3-48P01763 117 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 BSXQ3C1V8 233 aa12.38□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 IFI27L2Q9H2X8 130 aa12.38□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TANC2Q9HCD6 1990 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 IGHV1-46P01743 117 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TPPP2P59282 170 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 MLANAQ16655 118 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 DERL1Q9BUN8 251 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 DIRC3C9JPN6 131 aa12.37□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 MIC13Q5XKP0 118 aa12.37□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.36□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 IGKV1-16P04430 117 aa12.36□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 NIT1Q86X76 327 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 S1PR3Q99500 378 aa12.36□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 C17orf58Q2M2W7 97 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TIMM23BQ5SRD1 257 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZS92 163 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 OR5AU1Q8NGC0 362 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 CCL17Q92583 94 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TMEM147Q9BVK8 224 aa12.36□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 GAGE12BA1L429 117 aa12.35□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 IMMP2LQ96T52 175 aa12.35□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 CEACAM4O75871 244 aa12.34□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 MS4A5Q9H3V2 200 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 Q9UFV3 132 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 FBXL7Q9UJT9 491 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 F2Z2F3 143 aa12.34□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 APELAP0DMC3 54 aa12.34□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 SAMD13Q5VXD3 122 aa12.34□□□□□ -0.43
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CTIF-205ENST00000587860 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 PET117Q6UWS5 81 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TMEM186Q96B77 213 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TMEM160Q9NX00 188 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 ZNF586Q9NXT0 402 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 TP73-AS1Q9UF72 201 aa12.34□□□□□ -0.43
CTIF-205ENST00000587860 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 NPPCP23582 126 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 BAGE3Q86Y29 109 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 BAGE2Q86Y30 109 aa12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CTIF-205ENST00000587860 NAT8Q9UHE5 227 aa12.33□□□□□ -0.44
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