RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF580Q9UK33 172 aa21.56■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC38A11Q08AI6 406 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 C19orf35Q6ZS72 473 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5C1Q8NGR4 320 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T6Q8NHC8 308 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM3Q9BZL3 60 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSPAN9O75954 239 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q8N2B8 174 aa21.55■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAAR5O14804 337 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLINT1Q14677 625 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM95Q3KNT9 176 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARPC5LQ9BPX5 153 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 THYN1Q9P016 225 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXL17Q9UF56 701 aa21.54■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 FN1P02751 2386 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PMS2P5A8MQ11 134 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPRK1P41145 380 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARL16Q0P5N6 197 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 HAPLN4Q86UW8 402 aa21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRH1P02810 166 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6V1FQ16864 119 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 C19orf54Q5BKX5 351 aa21.52■■□□□ 1.04
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL2L11O43521 198 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 DFFBO76075 338 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 MFAP2P55001 183 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 PVRIGQ6DKI7 326 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 ETFRF1Q6IPR1 90 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZSV7 163 aa21.51■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35B1P78383 322 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP5SQ99766 215 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 GGACTQ9BVM4 153 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 DLK1P80370 383 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPCMLQ14982 345 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 CACNG8Q8WXS5 425 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM147Q9BVK8 224 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 BOLA1Q9Y3E2 137 aa21.5■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMCO3A2RU48 225 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD69Q07108 199 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF266Q14584 549 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC35E1Q96K37 410 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 FANCD2OSQ96PS1 177 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 UQCC1Q9NVA1 299 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 DMRT1Q9Y5R6 373 aa21.49■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRSS46E5RG02 174 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BUA1 57 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 IFNA5P01569 189 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIFP30405 207 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 MS4A10Q96PG2 267 aa21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2J3O76001 311 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 MT-CO2P00403 227 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC16A13Q7RTY0 426 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXL7Q9UJT9 491 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAST4O15021 2626 aa21.47■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSMB11A5LHX3 300 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 SOX15O60248 233 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF329Q86UD4 541 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 WFDC1Q9HC57 220 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERTAD4Q9NUC0 356 aa21.46■■□□□ 1.03
CTDNEP1-201ENST00000318988 JTBO76095 146 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRGV3P03979 118 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 PF4V1P10720 104 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHOGP84095 191 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 CFHR3Q02985 330 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKR1C1Q04828 323 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 NECAP1Q8NC96 275 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 C16orf95Q9H693 158 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNDC10F2Z333 226 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 MLANAQ16655 118 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCGB1C1Q8TD33 95 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLA2Q9H6Q3 261 aa21.45■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 I3L2K1 104 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFA7O95182 113 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 IGHG4P01861 327 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TPPP2P59282 170 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX38Q6PEX7 206 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC51BQ86UW2 128 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACY3Q96HD9 319 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPVFQ9HCQ7 196 aa21.44■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM223BA6NKX1 122 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFB8O95169 186 aa21.43■■□□□ 1.02
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRI3O95415 125 aa21.43■■□□□ 1.02
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