RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	ZSCAN26	Q16670	478 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	PP6455	Q8WZ26	134 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	SPSB1	Q96BD6	273 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52B2	Q96RD2	323 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	DOK5	Q9P104	306 aa		3.59	□□□□□ -1.83
SNAP23-223	ENST00000627440	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT7	O43581	403 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ALPL	P05186	524 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ATF1	P18846	271 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	CCL1	P22362	96 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	NPPC	P23582	126 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	UCP1	P25874	307 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	OMP	P47874	163 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYBA4	P53673	196 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	AP2S1	P53680	142 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC18A1	P54219	525 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SLA	Q13239	276 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	DGCR6	Q14129	220 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	BAP18	Q8IXM2	172 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	CNPY4	Q8N129	248 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	GPHA2	Q96T91	129 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	MRO	Q9BYG7	248 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A31	Q9H0C2	315 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	IFT22	Q9H7X7	185 aa		3.58	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	GGTLC3	B5MD39	225 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440		E5RGE8	158 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440		M0R2Z0	102 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC17A2	O00624	439 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	GPX5	O75715	221 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYZL1	O95825	349 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	KDELR2	P33947	212 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	PRCD	Q00LT1	54 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	PCLAF	Q15004	111 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ODF4	Q2M2E3	257 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	TTC23	Q5W5X9	447 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZTI0	123 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT11	Q96G61	164 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00052	Q96N35	136 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	C8orf49	Q96NF6	230 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	NSG2	Q9Y328	171 aa		3.57	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SELENOF	O60613	162 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	BPGM	P07738	259 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	RRAS	P10301	218 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	TIRAP	P58753	221 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	STPG4	Q8N801	248 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	COQ8A	Q8NI60	647 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	METTL26	Q96S19	204 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	VAPA	Q9P0L0	249 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM235	A6NFC5	223 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	C9orf118	A6NHY6	69 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440		F6UB75	175 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ITGB1BP1	O14713	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	FFAR1	O14842	300 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS1	P07477	247 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF85	Q03923	595 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	TPBG	Q13641	420 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-223	ENST00000627440	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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