RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	LALBA	P00709	142 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	RBP4	P02753	201 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	TCRB	P04435	133 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	PRSS2	P07478	247 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	MELTF	P08582	738 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	LIMS3	P0CW19	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	LIMS4	P0CW20	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CEL	P19835	753 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CAV2	P51636	162 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	UBE2E1	P51965	193 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	WNT4	P56705	351 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	GABARAPL2	P60520	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ZP1	P60852	638 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	KLRD1	Q13241	179 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	RAB31	Q13636	194 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792		Q499Y3	187 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CD177	Q8N6Q3	437 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CHST4	Q8NCG5	386 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	OR4F5	Q8NH21	305 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	OR5R1	Q8NH85	324 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ASB13	Q8WXK3	278 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	DYRK2	Q92630	601 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM210B	Q96KR6	192 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	SPACA5	Q96QH8	159 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CHST6	Q9GZX3	395 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	BEX1	Q9HBH7	125 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ESM1	Q9NQ30	184 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	SIGLEC8	Q9NYZ4	499 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ING4	Q9UNL4	249 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		3.73	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792		K7EP13	123 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	GABRP	O00591	440 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	OR2H2	O95918	312 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	IGLV2-11	P01706	119 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	IGHV4-59	P01825	116 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	HLA-A	P01891	365 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	MAS1	P04201	325 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ARG1	P05089	322 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF728	P0DKX0	622 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CCL3L1	P16619	93 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	SERPINA2	P20848	420 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	S100A11	P31949	105 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	AQP4	P55087	323 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	DHODH	Q02127	395 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	TNFRSF9	Q07011	255 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	GNMT	Q14749	295 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF146	Q15072	292 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	XAF1	Q6GPH4	301 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	TEX261	Q6UWH6	196 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	LINC00596	Q86U02	117 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	OSR2	Q8N2R0	312 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	PXT1	Q8NFP0	134 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	GHSR	Q92847	366 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	RETN	Q9HD89	108 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792		U3KQ87	197 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		3.72	□□□□□ -1.81
ZNF540-204	ENST00000586792	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
ZNF540-204	ENST00000586792	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ZNF540-204	ENST00000586792	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
ZNF540-204	ENST00000586792	ODAM	A1E959	279 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ZNF540-204	ENST00000586792	TMEM218	A2RU14	115 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ZNF540-204	ENST00000586792	C17orf98	A8MV24	154 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ZNF540-204	ENST00000586792		H3BUX3	64 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ZNF540-204	ENST00000586792	AIP	O00170	330 aa		3.71	□□□□□ -1.82
ZNF540-204	ENST00000586792	DLEU1	O43261	78 aa		3.71	□□□□□ -1.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms