RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	S100A14	Q9HCY8	104 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRELID3B	Q9Y3B1	194 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	MYCBP2	O75592	4640 aa		6.62	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC17A2	O00624	439 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	BET1	O15155	118 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CYB5B	O43169	146 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CDK1	P06493	297 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	FCGR3A	P08637	254 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	UCHL1	P09936	223 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPP1	P10451	314 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPA2	P15927	270 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	NPY1R	P25929	384 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM3B	P58499	235 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	PAFAH1B2	P68402	229 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	P2RY14	Q15391	338 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	C12orf74	Q32Q52	190 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CMTM3	Q96MX0	182 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	RNF2	Q99496	336 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	SMPX	Q9UHP9	88 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNK7	Q9Y2U2	307 aa		6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	ERICH4	A6NGS2	130 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	EPM2A	B3EWF7	344 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHEK1	O14757	476 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	FCGR3B	O75015	233 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	C4orf46	Q504U0	113 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	AHSA2	Q719I0	299 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCTD9	Q7L273	389 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR4S2	Q8NH73	311 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CYGB	Q8WWM9	190 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	GIMAP1	Q8WWP7	306 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	AGRN	O00468	2067 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		6.6	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR2T8	A6NH00	312 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CGB1	A6NKQ9	187 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC22A5	O76082	557 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	FGF2	P09038	288 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CD36	P16671	472 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	TIRAP	P58753	221 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	FOXI1	Q12951	378 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q6ZS49	121 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	STH	Q8IWL8	128 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	VKORC1L1	Q8N0U8	176 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR10C1	Q96KK4	312 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	GINS4	Q9BRT9	223 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	BET1L	Q9NYM9	111 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	CELA1	Q9UNI1	258 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	NACA	E9PAV3	2078 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	MFNG	O00587	321 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	HRAS	P01112	189 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	REG1A	P05451	166 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	GNAO1	P09471	354 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	HLA-G	P17693	338 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	TFPI2	P48307	235 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	CLDN12	P56749	244 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR2B8P	P59922	312 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLA2G7	Q13093	441 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB11B	Q15907	218 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB3C	Q96E17	227 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	MND1	Q9BWT6	205 aa		6.58	□□□□□ -1.36
TOM1L1-223	ENST00000576932	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36

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