RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 MSGN1A6NI15 193 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 DBX1A6NMT0 343 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 H3BUA1 57 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SSNA1O43805 119 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CRYZL1O95825 349 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 PRH1P02810 166 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CSN3P07498 182 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 RRASP10301 218 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 LGALS7P47929 136 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SRPXP78539 464 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 FCN2Q15485 313 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 TMEM177Q53S58 311 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 UXS1Q8NBZ7 420 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 IL22RA2Q969J5 263 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 PLEKHA2Q9HB19 425 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.61□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 ADAP1O75689 374 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 HPRT1P00492 218 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 IGKV1-5P01602 117 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 P0C879 139 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 RPA2P15927 270 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 TNXAQ16473 311 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SLC35G3Q8N808 338 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 MED28Q9H204 178 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 EDA2RQ9HAV5 297 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 COMMD9Q9P000 198 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 RYR2Q92736 4967 aa9.6□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 A0A0G2JRQ6 117 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 A8MZ25 164 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 CCSO14618 274 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 HOXB5P09067 269 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SULT1A3P0DMM9 295 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SULT1A4P0DMN0 295 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 BCAP31P51572 246 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 PRSS8Q16651 343 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 HAGHQ16775 308 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 C10orf55Q5SWW7 151 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 SEC22AQ96IW7 307 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-212ENST00000485532 RETNQ9HD89 108 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRAME-212ENST00000485532 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 HMX3A6NHT5 357 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 BMPR1BO00238 502 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 GOSR2O14653 212 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SIX6O95475 246 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 OR9G9P0C7N8 305 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 NQO2P16083 231 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 HLA-GP17693 338 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 CXCL3P19876 107 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 EDN2P20800 178 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 G6PCP35575 357 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 POU2AF1Q16633 256 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-212ENST00000485532 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 NMSQ5H8A3 153 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 GGNBP1Q5YKI7 109 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 C19orf35Q6ZS72 473 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TEX45Q8NA69 505 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 OR11H7Q8NGC8 314 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TMEM68Q96MH6 324 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 LYSTQ99698 3801 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 MGAT4CQ9UBM8 478 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SELENOKQ9Y6D0 94 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 MARCH11A6NNE9 402 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 MPTX1A8MV57 137 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 BRI3O95415 125 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 HRASP01112 189 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 AKR1C2P52895 323 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 SSX9Q7RTT3 188 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 CHAC2Q8WUX2 184 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 GPR146Q96CH1 333 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 USMG5Q96IX5 58 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TMED3Q9Y3Q3 217 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ATG12O94817 140 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 H2BFSP57053 126 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 ERVK-16P61578 105 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 OR4A47Q6IF82 309 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-212ENST00000485532 LCN12Q6JVE5 192 aa9.56□□□□□ -0.88
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