RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524481.5

PTPRK-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 3,157 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-216ENST00000524481 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 PPOXP50336 477 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 RPL8P62917 257 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF726P1Q15940 193 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 FAM24BQ8N5W8 94 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 PAGE4O60829 102 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 COA4Q9NYJ1 87 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 C15orf61A6NNL5 157 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 IGFBP2P18065 325 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 PRRX1P54821 245 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF429Q86V71 674 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 NECAP1Q8NC96 275 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 VPS13CQ709C8 3753 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 H0YJW9 148 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 CD5P06127 495 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 CR1LQ2VPA4 569 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM155Q4W5P6 130 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 MARVELD3Q96A59 401 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 C12orf57Q99622 126 aa9.55□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 A0A0U1RQK1 487 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1W2PR64 198 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1W2PRV1 198 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 C17orf112F2Z3M2 114 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 NDUFA2O43678 99 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 HBE1P02100 147 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 MMDQ15546 238 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 EFNB3Q15768 340 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 DDB2Q92466 427 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 CYB5BO43169 146 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 KIR2DS2P43631 304 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM41BQ5BJD5 291 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 TREML4Q6UXN2 200 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 SSX8Q7RTT4 187 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 NABP2Q9BQ15 211 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 CLEC7AQ9BXN2 247 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 KPTNQ9Y664 436 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 PXMP4Q9Y6I8 212 aa9.54□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 H3BQ15 152 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 UPK2O00526 184 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 OR10J4P0C629 311 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 B2MP61769 119 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ADIRFQ15847 76 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 FAM78BQ5VT40 261 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 CORO2AQ92828 525 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 BPESC1Q9GZL8 116 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 PRNDQ9UKY0 176 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 WASHC3Q9Y3C0 194 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 LIPFP07098 398 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 P0C879 139 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 IL3RAP26951 378 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 LFNGQ8NES3 379 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 FCN1O00602 326 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 COL8A1P27658 744 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 OR10J1P30954 320 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 OR4P4Q8NGL7 312 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 TMEM186Q96B77 213 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 NPVFQ9HCQ7 196 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 ZANQ9Y493 2812 aa9.52□□□□□ -0.88
PTPRK-216ENST00000524481 A0A1W2PPH5 198 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 NUDT19A8MXV4 375 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 TIMM23O14925 209 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 OR7C2O60412 319 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 OR5G3P0C626 314 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 SERF2P84101 59 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 RAB31Q13636 194 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 VMA21Q3ZAQ7 101 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 OR1L8Q8NGR8 309 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 KIAA1456Q9P272 454 aa9.52□□□□□ -0.89
PTPRK-216ENST00000524481 CHD6Q8TD26 2715 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 137.1 ms